\documentclass[a4paper, oneside, 10pt]{article}
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\date{\today}
\title{}
\author{}
\begin{document}



\section{\texorpdfstring{Curso UFABC}{Curso UFABC}}
\label{sec:curso_ufabc}

\begin{itemize}
  \item O curso será oferecido presencialmente entre os dias \emph{\underline{10 a 27 de setembro}} de 2019, nas terças e sextas-feiras das 9h as 17h. Nos outros dias da semana haverá atividades de tutoriais e atendimento pelo fórum.
\end{itemize}


Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação e material sobre a disciplina, ministrada no programa de \href{http://propg.ufabc.edu.br/cta}{pós-graduação em Ciência e Tecnologia Ambiental da UFABC}. 

\textbf{\underline{Atividades Preparatórias}}
\\
Faça as \href{http://ecor.ib.usp.br/doku.php?id=01_curso_atual:pre_curso}{atividades preparatórias} até antes do início das aulas

\textbf{\underline{Matricula}}
Veja informações em: \href{http://ecor.ib.usp.br/doku.php?id=01_curso_atual:start\%23matricula}{start#matricula}.

\subsection{\texorpdfstring{Informações Gerais}{Informaoes Gerais}}
\label{sec:informaoes_gerais}


Essa disciplina é baseada na oferecida pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia da Universidade de São Paulo

\subsubsection{\texorpdfstring{Professor Responsável}{Professor Responsavel}}
\label{sec:professor_responsavel}

\begin{itemize}
  \item \href{http://ecologia.ib.usp.br/labtrop}{Alexandre Adalardo de Oliveira}, Lab. Ecologia de Florestas Tropicais \emph{LABTROP} - IBUSP (adalardo@usp.br)
  \item \href{http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4764135T8}{Leandro Reverberi Tombosi}. \href{http://cecs.ufabc.edu.br/index.php/docentes/contatos/23-docentes/353-leandro-reverberi-tambosi.html}{Centro de Engenharia, Modelagem e Ciências Aplicadas} - UFABC
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Professores Colaboradores}{Professores Colaboradores}}
\label{sec:professores_colaboradores}

\begin{itemize}
  \item \href{http://ecologia.ib.usp.br/let/doku.php?id=prado:start}{Paulo Inácio K. L. Prado}, Laboratório de Ecologia Teórica -IBUSP   (prado@ib.usp.br) 
\end{itemize}


\paragraph{\texorpdfstring{Colaboração}{Colaboraao}}
\label{sec:colaboraao}

\begin{itemize}
  \item Andre Chalom (notaR)
\end{itemize}


 Danilo Muniz
\begin{itemize}
  \item Melina Leite
    \item Bruno Travassos   
  \end{itemize}


*/

\paragraph{\texorpdfstring{Monitores}{Monitores}}
\label{sec:monitores}

      \begin{itemize}
  \item Douglas Cirino
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Período e Horários}{Periodo e Horarios}}
\label{sec:periodo_e_horarios}

\begin{itemize}
  \item Disciplina condensada, \textbf{ 10 a 27 de setembro de 2019}.
  \item Aulas teóricas e práticas terças e sextas, 9:00-17:00 horas.
  \item Atendimento \emph{online} pelo \href{http://bie5782.138098.n3.nabble.com/}{forum} segundas, quartas e quintas, 9:00-18:00 horas.
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Locais das aulas}{Locais das aulas}}
\label{sec:locais_das_aulas}


\textbf{Universidade Federal do ABC (UFABC)}

Curso de Pós Graduação em Ciência e Tecnologia Ambiental.

Campus Santo André.
Av. dos Estados, 5001 – Bairro Santa Terezinha – Santo André – SP – CEP: 09210-580

\subsection{\texorpdfstring{Programação}{Programaao}}
\label{sec:programaao}

\begin{itemize}
  \item  Faça as \href{http://ecor.ib.usp.br/doku.php?id=01_curso_atual:pre_curso}{Atividades Preparatórias} antes do primeiro dia de aula.
  \item A disciplina consiste de aulas teóricas às segundas, quartas e sextas, seguidas de tutoriais e exercícios com o apoio dos monitores. 
  \item Espera-se que as terças e quintas estejam reservadas para estudo. Nesses dias os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo \href{http://bie5782.138098.n3.nabble.com/}{Forum online}.
\end{itemize}
\begin{longtable}{|l|l|l|l|l|}
\hline
\multicolumn{5}{|l|}{\textbf{Primeira Semana}} \\ 
\hline
 
\textbf{ Data   } & \textbf{Período   } & \textbf{ Local } & \textbf{ Assunto } & \textbf{Instrutor(es)} \\ 
\hline
 
10/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  & Filosofia e histórico da linguagem R    & Professores \\ 
\hline
 
10/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Introdução ao R    &  Alexandre \\ 
\hline
 
10/09  & 14:00-15:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Funções Matemáticas    &  Professores e Monitores  \\ 
\hline
 
10/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Aula Funções Matemáticas   &  Alexandre   \\ 
\hline
 
11/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
12/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
13/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  &  Aula Leitura e Manipulação de Dados    & Alexandre \\ 
\hline
 
13/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Leitura e Manipulação de Dados  &  Equipe  \\ 
\hline
 
13/09  & 14:00-16:00 &  Sala de Computação  &  Aula Gráficos I    &  Alexandre  \\ 
\hline
 
13/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Tutorial Gráficos I   &  Equipe   \\ 
\hline
 
\multicolumn{5}{|l|}{\textbf{Segunda Semana}} \\ 
\hline
 
\textbf{ Data   } & \textbf{Período   } & \textbf{ Local } & \textbf{ Assunto } & \textbf{Instrutor(es)} \\ 
\hline
 
16/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
17/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  &  Aula Gráficos II    & Alexandre \\ 
\hline
 
17/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Gráficos II  &  Equipe  \\ 
\hline
 
17/09  & 14:00-16:00 &  Sala de Computação  &  Aula Teste de Hipótese    &  Alexandre  \\ 
\hline
 
17/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Tutorial Teste de Hipótese   &  Equipe   \\ 
\hline
 
18/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
19/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
20/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  &  Aula Regressão Linear I    & Alexandre \\ 
\hline
 
20/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Regressão I  &  Equipe  \\ 
\hline
 
20/09  & 14:00-16:00 &  Sala de Computação  &  Aula Regressão Linear II    &  Alexandre  \\ 
\hline
 
20/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Tutorial Regressão Linear II  &  Equipe   \\ 
\hline
 
\multicolumn{5}{|l|}{\textbf{Terceira Semana}} \\ 
\hline
 
\textbf{ Data   } & \textbf{Período   } & \textbf{ Local } & \textbf{ Assunto } & \textbf{Instrutor(es)} \\ 
\hline
 
23/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
24/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  &  Aula Simulação \& Permutação I  & Alexandre \\ 
\hline
 
24/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Simulação \& Permutação I  &  Equipe  \\ 
\hline
 
24/09  & 14:00-16:00 &  Sala de Computação  &  Aula Simulação \& Permutação II    &  Alexandre  \\ 
\hline
 
24/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Aula Simulação \& Permutação II   &  Equipe   \\ 
\hline
 
25/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
26/09  & 9:00-18:00  &  Fórum    &  Plantão de Dúvidas   &  Monitores  \& Professores \\ 
\hline
 
27/09  & 9:00-10:30 &  Sala de Computação  &  Aula Noções de Programação I    & Alexandre \\ 
\hline
 
27/09  & 11:00-12:30 &  Sala de Computação  &  Tutorial Programação I  &  Equipe  \\ 
\hline
 
27/09  & 14:00-16:00 &  Sala de Computação  &  Aula Noções de Programação II    &  Alexandre  \\ 
\hline
 
27/09  & 16:00-18:00  &  Sala de Computação  &  Tutorial Noções de Programação II  &  Equipe   \\ 
\hline
 
\end{longtable}



\subsection{\texorpdfstring{Bibliografia Básica}{Bibliografia Basica}}
\label{sec:bibliografia_basica}


A quantidade de material disponível sobre programação em R é muito extensa. Aqui apresentamos uma compilação da documentação oficial que consideramos mais importante e algumas fontes que avaliamos ser mais interessante. 

Para os que acompanham cursos online, indicamos o curso de \href{https://www.coursera.org/course/rprog}{programação em R} no Coursera oferecido pela \href{https://www.coursera.org/jhu}{Johns Hopkins University}. 

Há também um interessante curso interativo  on line chamado \href{http://tryr.codeschool.com/}{TryR}. 

\subsubsection{\texorpdfstring{Livros}{Livros}}
\label{sec:livros}


\textbf{William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002.}
Conhecido na comunidade R como \emph{,,The Book"}, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o \texttt{MASS}\footnote{este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN}, que faz parte da instalação básica do R. Visite o \href{http://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS4/}{site} do livro para atualizações, exercícios e muito mais.

\textbf{John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002.}
Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, \texttt{car}, tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o \href{http://socserv.socsci.mcmaster.ca/jfox/Books/Companion/index.html}{site} do livro.

\textbf{John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman \& Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005.} Derivado de manual \href{http://www.math.csi.cuny.edu/Statistics/R/simpleR/printable/simpleR.pdf}{disponível gratuitamente} no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o \href{http://wiener.math.csi.cuny.edu/UsingR/}{site} do livro, e o pacote \textbf{usingR}.

\textbf{Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007.} Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o \href{http://www.bio.ic.ac.uk/research/mjcraw/therbook/index.htm/}{site} do livro.

\subsubsection{\texorpdfstring{Documentação On Line}{Documentaao On Line}}
\label{sec:documentaao_on_line}


\textbf{NOTA:} Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção \href{http://cran.r-project.org/other-docs.html}{Contributed Documentation} do site do R.

\textbf{Venables, W.; Smith, D.M; \& R Development Team  }  \href{http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf}{An Introduction to R. Manual online}. Manual oficial de introdução ao R.

\textbf{Carlos Alzola and Frank E. Harrell \href{http://cran.r-project.org/doc/contrib/Alzola+Harrell-Hmisc-Design-Intro.pdf}{An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries}” } O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.

\textbf{Petra Kuhnert and Bill Venables \href{http://cran.r-project.org/doc/contrib/Kuhnert+Venables-R_Course_Notes.zip}{An Introduction to R: Software for Statistical Modelling \& Computing}.} Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.

\subsubsection{\texorpdfstring{Veja também}{Veja tambem}}
\label{sec:veja_tambem}


Duas dicas do monitor Vitor Rios:
\begin{itemize}
  \item \href{http://www.computerworld.com/article/2497143/business-intelligence-beginner-s-guide-to-r-introduction.html?null}{ Beginner's guide to R} - uma breve introdução sobre a linguagem publicada na revista online \emph{ComputerWorld}. Um guia compacto sobre tópicos básicos.
  \item\href{http://adv-r.had.co.nz}{ Advanced R}. Compilação online do livro de mesmo nome de autoria de Hadley Wickham. Descrição do publico alvo, pelo autor: \emph{,,The book is designed primarily for R users who want to improve their programming skills and understanding of the language."} 
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Outros Recursos}{Outros Recursos}}
\label{sec:outros_recursos}

\begin{itemize}
  \item \href{http://tryr.codeschool.com/}{TryR}: Sistema online interativo de aprendizagem da linguagem R, nos moldes do Codecademy e W3School.  
  \item \textbf{\emph{Taskviews}}:  São listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no \href{http://cran.r-project.org/mirrors.html}{CRAN}\footnote{Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R}. Para nossa área, p.ex, há os \emph{views} \emph{Environmetrics}, \emph{Multivariate}, \emph{Genetics}, \emph{Spatial}. Todo espelho de \href{http://cran.r-project.org/mirrors.html}{CRAN} mantém uma cópia dos \emph{taskviews}. Para o espelho da FMV-USP o link é \url{http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/}.
  \item \href{http://crantastic.org/}{CRANTASTIC!}: Excelente sítio com resumos de todos os pacotes do \href{http://cran.r-project.org/mirrors.html}{CRAN}\footnote{Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R}. Tem recursos para buscas de pacotes e funções por assuntos, resumos de cada pacote, avaliações de pacotes e muito mais. Juntamente com as \textbf{taskviews}, é o recurso básico para encontrar o pacote que você busca no R.
  \item \href{http://journal.r-project.org/}{The R Journal}: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
  \item \href{http://www.jstatsoft.org}{Journal of Statistical Software}: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre \href{http://www.jstatsoft.org/v22}{uso do R em ecologia}, e outro sobre \href{http://www.jstatsoft.org/v24}{análises de redes} (com ênfase para dados de ciências sociais).
  \item \href{http://www.statmethods.net/index.html}{Quick R}, de Rob Kabakoff: um guia rápido \emph{on line} muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
  \item \href{http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming}{The R Wikibook}: manual muito completo na coleção de \href{http://en.wikibooks.org/wiki/Main_Page}{Wiki Books}.
\end{itemize}


\end{document}
