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\section{\texorpdfstring{Cecilia S. Andreazzi}{Cecilia S Andreazzi}}
\label{sec:cecilia_s_andreazzi}


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Doutoranda em Ecologia, USP. 

Minha tese trata sobre evolução e coevolução em redes de interação antagonistas, sob a orientação do Prof. Paulo Roberto Guimarães Jr. 

\subsection{\texorpdfstring{Meus Exercícios}{Meus Exercicios}}
\label{sec:meus_exercicios}


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\subsection{\texorpdfstring{Proposta de Trabalho Final}{Proposta de Trabalho Final}}
\label{sec:proposta_de_trabalho_final}


\subparagraph{\texorpdfstring{Plano A}{Plano A}}
\label{sec:plano_a}


\textbf{Coevolução das frequências alélicas em um par de espécies}

Uma simples forma de se modelar a coevolução em um par de espécies é considerar espécies haplóides com gerações discretas, nas quais a interação é governada por meio de um locus gênico com dois alelos e ocorre através do pareamento de alelos. Por exemplo, a espécies X tem alelos A e a e a espécies Y tem alelos B e b. Caso a interação entre o par de espécies seja mutualista, ambas as espécies têm um incremento em sua aptidão ao interagir com um parceiro que tenha um alelo “casado”(por exemplo A ganha ao interagir com B, mas não ao interagir com b). Já no caso de antagonismos, uma das espécies teria sua aptidão aumentada ao interagir com o parceiro de alelo “casado”, mas a outra teria a aptidão diminuída. 
A tarefa dessa função é calcular as frequências alélicas de A e B em cada geração em função das suas aptidões, conforme proposto por Nuismer et al. 1999. O cálculo da aptidão será baseado em constantes relacionadas à sensibilidade das espécies em relação às frequências alélicas dos seus parceiros e no sinal da interação.
Os argumentos dessa função serão as frequências alélicas iniciais, as constantes relacionadas à sensibilidade das espécies, o sinal da interação e o número de gerações. 
Como resultado, a função retornará um gráfico da variação das frequências dos alelos A e B ao longo do tempo.   

\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/ci.andreazzi/nuismer_et_al_1999_gene_flow_and_geographically_structured_coevolution.pdf}{nuismer\_et\_al\_1999\_gene\_flow\_and\_geographically\_structured\_coevolution.pdf}

\textbf{Daniel (Musgo):} Muito interessante. O sinal da interação significa interação positiva para ambos (+|+) ou negativa para ambos (-|-)? Seria possível modelar interações do tipo positiva para um e neutra para outro (+|0) ou positiva para um e negativa para outro (+|-)?

\textbf{Cecilia:} Acredito que sim, minha idéia inicial é que o sinal da interação possa ser modificado pelo usuário.

\textbf{Daniel (Musgo):} Ok! Acho que vai ficar ótimo. Complete a função para um tipo de interação só. Em seguida acrescente as outras opções. Desta forma você vai conseguir administrar o tempo melhor e não se perder tentando fazer algo muito grande.

\subparagraph{\texorpdfstring{Plano B}{Plano B}}
\label{sec:plano_b}


\textbf{Gráficos predador-presa}

A tarefa seria resolver as equações de Lotka-Volterra para o cálculo das abundâncias de duas espécies (1 predador e 1 presa) ao longo do tempo e produzir os gráficos que mostrem  a variação nos tamanhos populacionais das duas espécies. Os argumentos seriam a resposta numérica do predador e sua taxa de mortalidade e a taxa intrínseca de crescimento da presa, a capacidade suporte e sua resposta funcional. 

\subparagraph{\texorpdfstring{Código da função}{Codigo da funao}}
\label{sec:codigo_da_funao}


\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/ci.andreazzi/funcao.r}{funcao.r}

\subparagraph{\texorpdfstring{Página de ajuda}{Pagina de ajuda}}
\label{sec:pagina_de_ajuda}


\href{media/bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/ci.andreazzi/help_coevolv.r}{help\_coevolv.r}

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