\documentclass[a4paper, oneside, 10pt]{article}
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\begin{document}



\section{\texorpdfstring{Propostas trabalho final}{Propostas trabalho final}}
\label{sec:propostas_trabalho_final}


\section{\texorpdfstring{PROPOSTA - A}{PROPOSTA  A}}
\label{sec:proposta__a}


\subsection{\texorpdfstring{Função para calcular abundância por classes de tamanho para zooplâncton}{Funao para calcular abundancia por classes de tamanho para zooplancton}}
\label{sec:funao_para_calcular_abundancia_por_classes_de_tamanho_para_zooplancton}


Dentro do projeto de mestrado foi utilizado equipamento de identificação semi automática  para zooplâncton – FlowCAM  O principio deste equipamento é fotografar cada partícula que passa pelo fluido enfrente da camera, em seguida as particulas são classificadas manualmente em grupos de interesse do pesquisador, neste caso grupos taxonômicos do zooplâncton. 
O software deste instrumento gera uma planilha, por amostra, em formato “.csv” este arquivo contem varias medições da partícula que foi fotografada.
A proposta de função para o curso, é calcular a abundância por classes de tamanho, para cada grupo taxonômico utilizando a informação da coluna ESD (Equivalent Spherical Diameter - μm). 

Para isto:

1. Com base no arquivo inicial: extrair em outro data set o numero de organismos por classe de tamanho (ESD) de cada grupo taxonômico.

2.Calcular a abundância (Equação 1) por classe de tamanho em cada estação.

\centering\includegraphics[keepaspectratio=true,width=0.8\textwidth]{bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/tuismara/eq_abundancia}


3.Calcular o valor médio de cada classe de tamanho em cada grupo taxonômico

4.Finalmente gerar um data frame e um gráfico de linhas com os valores médios de cada classe de tamanho 

\centering\includegraphics[keepaspectratio=true,width=0.8\textwidth]{bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/tuismara/exemplo_de_grafico_1}


\subsection{\texorpdfstring{PROPOSTA - B}{PROPOSTA  B}}
\label{sec:proposta__b}


\subsection{\texorpdfstring{Gráfico de abundância de grupos taxonômicos}{Grafico de abundancia de grupos taxonomicos}}
\label{sec:grafico_de_abundancia_de_grupos_taxonomicos}


É comum na área da oceanografia biológica representar a abundância das espécies encontradas em uma campanha oceanográfica. A maioria de vezes estas representações são feitas plotando círculos de diferentes tamanhos que representam intervalos dos valores de abundância sobre a localização das estações de amostragem. Entretanto quando a localização das estações é muito próxima uma da outra, se torna difícil a visualização no mapa. Com base nesta dificuldade, a proposta para realizar a função é: o cálculo da abundância dos diferentes grupos taxonômicos e gerar um gráfico como o seguinte exemplo\centering\includegraphics[keepaspectratio=true,width=0.8\textwidth]{bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/tuismara/fig_abundancia}


A proposta A me parece bastante simples, talvez um pouco demais, já que é apenas o calculo da abundância e um gráfico simples. Se você tem a variação dos dados, talvez fosse melhor plotar toda a variação, ao invés da média apenas. A proposta B, pelo que eu entendi, se propõe a reproduzir o gráfico exibido, é isso? seria um desafio interessante se você conseguisse fazer com que o gráfico se ajustasse aos dados, impedindo a sobreposição dos círculos, facilitando a visualização
----\emph{\href{mailto:vrios@usp.br}{ Vitor Rios}}

\subsection{\texorpdfstring{PROPOSTA AJUSTADA}{PROPOSTA AJUSTADA}}
\label{sec:proposta_ajustada}


Olá Vitor, obrigada pela avaliação. Farei a proposta B. No entanto, com relação à situação da sobreposição dos círculos, concordo com você que melhoraria a visualização, mas ficaria um gráfico muito comprido, se o número de especies for muito alto. Porém tentarei fazer o gráfico semelhante ao gráfico da proposta.

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