\documentclass[a4paper, oneside, 10pt]{article}
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\begin{document}



\section{\texorpdfstring{Proposta 2}{Proposta 2}}
\label{sec:proposta_2}


\subsubsection{\texorpdfstring{Inferindo estados comportamentais a partir da descrição de padrões de movimentação}{Inferindo estados comportamentais a partir da descriao de padroes de movimentaao}}
\label{sec:inferindo_estados_comportamentais_a_partir_da_descriao_de_padroes_de_movimentaao}


\subparagraph{\texorpdfstring{Contextualização}{Contextualizaao}}
\label{sec:contextualizaao}


O movimento de um organismo é definido como uma mudança na localização espacial do indivíduo no tempo, impulsionado por processos que atuam em múltiplas escalas espaciais e temporais. Os animais se movem motivados pela necessidade de executar atividades em diferentes tipos de habitat em um determinado intervalo de tempo. 
Um passo fundamental na Ecologia do Movimento é a descrição dos padrões de movimentação e a identificação de seus impulsores proximais e distais, a partir de dados de telemetria. 
Com o cálculo do ângulo de giro médio e a auto-correlação de velocidade e direção podemos fazer inferências sobre os estados comportamentais. Movimentos altamente direcionais possuem ângulos de giro próximos a 0 ° e são consistentes a longas distâncias, provavelmente representando trânsitos através de habitat ou entre habitats distintos, ou seja, movimentos de trânsito. Movimentos localizados, mais variáveis e com uma taxa mais alta de ângulos de virada agudos, próximos a 180°, representam um comportamento de busca e exploração, consistindo em movimentos mais convolutos.

\centering\includegraphics[keepaspectratio=true,width=0.8\textwidth]{bie5782/01_curso_atual/alunos/trabalho_final/annelandine/images}

\textbf{Legenda da imagem:} \texttt{a} $\rightarrow$ movimentos direcionais; \texttt{b} $\rightarrow$ movimentos localizados

Essa função visa, a partir de dados de localização, estabelecer estados comportamentais para cada trajetória de diferentes indivíduos e associá-los ao gênero dos animais marcados com transmissores. Testando, a hipótese que propõe diferenças nos padrões de movimentação ou atividade entre machos e fêmeas. 

\subsubsection{\texorpdfstring{Planejamento da função}{Planejamento da funao}}
\label{sec:planejamento_da_funao}


estcomp (\texttt{dados},\texttt{coord}, \texttt{date}, \texttt{id},\texttt{gen}, \texttt{sistcoord}= CRS()).
\begin{itemize}
  \item \texttt{dados} $\rightarrow$ data frame com os dados
  \item \texttt{coord} $\rightarrow$ coluna com coordenadas de localização (latitude e longitude).
  \item \texttt{date} $\rightarrow$ coluna com informações de dia e horário de cada localização \#já que dados de telemetria as  localizações obtidas são tipicamente dependentes da localização anterior e por isso espacial e temporalmente autocorrelacionadas.
  \item \texttt{id} $\rightarrow$ identificação de cada animal.
  \item \texttt{gen} $\rightarrow$ coluna com os gêneros dos animais.
  \item \texttt{sistcoord} $\rightarrow$ sistema de coordenadas
\end{itemize}


\subsubsection{\texorpdfstring{Pseudo-código}{Pseudocodigo}}
\label{sec:pseudocodigo}


\subparagraph{\texorpdfstring{Pressupostos}{Pressupostos}}
\label{sec:pressupostos}

\begin{itemize}
  \item class(\texttt{coord}) == ,,numeric".
  \item class(\texttt{gen}) == ,,character". 
  \item length(\texttt{coord})  ==  length(\texttt{gen}).
  \item Verificar a presença de NAs em alguma das colunas $\rightarrow$ retirá-los (\texttt{na.omit}) e colocar um \texttt{warning}
  \item class(\texttt{date}) == \texttt{POSIXct}
  \item require(adehabitatLT) $\rightarrow$ requer pacote adehabitatLT
\end{itemize}


\subparagraph{\texorpdfstring{Cálculos}{Calculos}}
\label{sec:calculos}

\begin{itemize}
  \item \texttt{traj} $\leftarrow$ as.ltraj(xy = \texttt{coord}, date= \texttt{date}, id= \texttt{id}, burst= \texttt{id}) \# transformando em trajeto.
  \item plot(\texttt{traj}) \#plotar a trajetória. 
  \item \texttt{traj.df} $\leftarrow$ ld(\texttt{traj}) \# a função ,,ld" converte ltraj em dataframe para melhor manejo dos pontos.
  \item A função ltraj retorna os valores (entre outros): 
  \item \texttt{dist} = distancia de cada passo. 
  \item \texttt{rel.angle} = angulo relativo (radianos), angulo entre um passo e outro (mudança de direção).
  \item \texttt{dt} = tempo entre localizações sucessivas (em segundos).
  \item \texttt{traj.df}\$\texttt{vel} $\leftarrow$ (dist/dt)*3.6 \#Calcular a \texttt{velocidade} entre um ponto e outro.
  \item Calcular a \texttt{média} de \texttt{velocidade} das fêmeas e a média de \texttt{velocidade} dos machos.
  \item Calcular a \texttt{média} dos \texttt{ângulos} de machos e fêmeas.
  \item Cálculo do \texttt{,,p-valor"}
\end{itemize}


\subparagraph{\texorpdfstring{Retornar}{Retornar}}
\label{sec:retornar}

\begin{enumerate}
  \item plot da trajetória
    \item data frame contendo os valores de velocidade, distância do passo, ângulo
    \item p-valor: probabilidade de machos e fêmeas se movimentarem com padrões diferentes.
  \end{enumerate}
 Comentários Pamela Santana 

Sobre sua proposta 2: ela tá bem bacana também! Tem alguns pontos pra pensarmos:

i) No pseudo-código o que são os seus \texttt{dados}? \texttt{coord} é um vetor? \texttt{date} é um vetor também? E a entrada de dados das coordenadas, será em minuto e segundo?

ii) Você faz alguns testes lógicos (\texttt{class(coord) == “numeric”}) e se a resposta for FALSE?

iii) Ao plotar a trajetória, você faz isso para vários indivíduos? Essa função seria para testar sempre a variação intra-específica? A inter-específica não?

iv) Para retornar o dataframe com os valores de velocidade, distância do passo, ângulo, você precisa criar este dataframe. Você cria \texttt{traj.df}, mas este \emph{objeto} não tem a distancia de cada passo e o ângulo.

v) Como você vai calcular o seu p-valor?

Ambas as suas propostas estão legais! Tem pequenos pontos em que tem uma divergência entre o que se obtém e o objetivo da função ou o que se calcula na função, mas tudo são coisas que podem ser alinhadas rapidinho. Mas é importante inserirmos controle de fluxo nas suas propostas. Eu seguiria com o plano A.

Qualquer dúvida que você tenha, me escreva (\emph{pcsantana@ib.usp.br}).

Um abraço!

\end{document}
