====== Cecilia S. Andreazzi ======

{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:eu.jpg?200|}}



Doutoranda em Ecologia, USP. 

Minha tese trata sobre evolução e coevolução em redes de interação antagonistas, sob a orientação do Prof. Paulo Roberto Guimarães Jr. 

===== Meus Exercícios =====

{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:aula1.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:aula2.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:aula3_mod.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:ex4.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:ex5.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:ex6.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:ex7.r|}}
{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:ex9.r|}}
===== Proposta de Trabalho Final =====

==Plano A==

**Coevolução das frequências alélicas em um par de espécies**

Uma simples forma de se modelar a coevolução em um par de espécies é considerar espécies haplóides com gerações discretas, nas quais a interação é governada por meio de um locus gênico com dois alelos e ocorre através do pareamento de alelos. Por exemplo, a espécies X tem alelos A e a e a espécies Y tem alelos B e b. Caso a interação entre o par de espécies seja mutualista, ambas as espécies têm um incremento em sua aptidão ao interagir com um parceiro que tenha um alelo “casado”(por exemplo A ganha ao interagir com B, mas não ao interagir com b). Já no caso de antagonismos, uma das espécies teria sua aptidão aumentada ao interagir com o parceiro de alelo “casado”, mas a outra teria a aptidão diminuída. 
A tarefa dessa função é calcular as frequências alélicas de A e B em cada geração em função das suas aptidões, conforme proposto por Nuismer et al. 1999. O cálculo da aptidão será baseado em constantes relacionadas à sensibilidade das espécies em relação às frequências alélicas dos seus parceiros e no sinal da interação.
Os argumentos dessa função serão as frequências alélicas iniciais, as constantes relacionadas à sensibilidade das espécies, o sinal da interação e o número de gerações. 
Como resultado, a função retornará um gráfico da variação das frequências dos alelos A e B ao longo do tempo.   

{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:nuismer_et_al_1999_gene_flow_and_geographically_structured_coevolution.pdf|}}

**Daniel (Musgo):** Muito interessante. O sinal da interação significa interação positiva para ambos (+|+) ou negativa para ambos (-|-)? Seria possível modelar interações do tipo positiva para um e neutra para outro (+|0) ou positiva para um e negativa para outro (+|-)?

**Cecilia:** Acredito que sim, minha idéia inicial é que o sinal da interação possa ser modificado pelo usuário.

**Daniel (Musgo):** Ok! Acho que vai ficar ótimo. Complete a função para um tipo de interação só. Em seguida acrescente as outras opções. Desta forma você vai conseguir administrar o tempo melhor e não se perder tentando fazer algo muito grande.

==Plano B==

**Gráficos predador-presa**

A tarefa seria resolver as equações de Lotka-Volterra para o cálculo das abundâncias de duas espécies (1 predador e 1 presa) ao longo do tempo e produzir os gráficos que mostrem  a variação nos tamanhos populacionais das duas espécies. Os argumentos seriam a resposta numérica do predador e sua taxa de mortalidade e a taxa intrínseca de crescimento da presa, a capacidade suporte e sua resposta funcional. 



==Código da função==


{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:funcao.r|}}



==Página de ajuda==

{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:ci.andreazzi:help_coevolv.r|}}