{{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:salatansio:img_5301d.jpg?200|}} ====== Sabrina Latansio ====== Bacharel em Ciências Biológicas pela UNESP, Mestre em Biodiversidade Vegetal e Meio Ambiente pelo IBt/SMA, Doutora em Biologia Vegetal pela UNICAMP, atual Pós-doutoranda da USP. Linha de pesquisa com ênfase em ecofisiologia do uso do Carbono e Nitrogênio em plantas arbóreas de florestas e savanas. Contatos: salatansio@yahoo.com.br, salatansio@hotmail.com [[http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4777506Z8|Currículo lattes]] {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:salatansio:master_s.pdf|Dissertação de Mestrado}} {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:salatansio:phd_thesis.pdf|Tese de Doutorado}} __**Apostilas de Introdução ao uso do R em português:**__ {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:salatansio:apostila_r_-_uerj.pdf|Apostila UERJ}} {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:salatansio:apostila_r_-_pire.inpa.pdf|Apostila PIRE/INPA}} __**Divulgação dos Artigos publicados:**__ ^ano^revista^link^ |2012|Journal of Mass Spectrometry| [[http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jms.3100/abstract;jsessionid=0BAAF6464516F6F13595DB1A71DEE545.d02t03|Application of MALDI-MS analysis of Rainforest]]| |2012|Planta Medica| [[https://www.thieme-connect.de/DOI/DOI?10.1055/s-0032-1320659|HT-MALDI-MS: A keystone for Brazilian biodiversity conservation]]| |2012|Revista Biota Neotropica|[[http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S1676-06032010000100020&script=sci_arttext|Fitossociologia de um Cerrado denso]]| |2010|Journal of Plant Physiology|[[http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0176161709004556|Specific leaf areas of the tank bromeliad Guzmania monostachia]]| |2009|Scientia Agricola|[[http://www.scielo.br/scielo.php?pid=S0103-90162009000400006&script=sci_arttext|Isotopic view of vegetation and carbon and nitrogen]]| |2008|Revista Biociências UNITAU|[[http://periodicos.unitau.br/ojs-2.2/index.php/biociencias/article/viewFile/561/296|Gas exchange, vegetative development, phenology]]| [[.:exec]] __**TRABALHO FINAL**__ **PROPOSTA 1** - Criar uma função no R que tenha como entrada/input um vasto conjunto de dados advindos de muitas espécies de plantas, com variáveis ecofisiológicas de diversas naturezas, e que seja capaz de buscar grupos funcionais possíveis entre as espécies avaliadas. Gerando gráficos/output dos prováveis grupos e suas variáveis determinantes. A idéia é que a função possa encontrar as maiores similaridades funcionais entre as espécies e agrupá-las. E se possível, que depois disso a função possa comparar os grupos criados com histogramas evolutivos que contenham informações sobre a evolução de cada espécie de planta estudada, de forma que forneça pistas e/ou possibilidades de quais atributos melhor se relacionam à história evolutiva das plantas estudadas. **PROPOSTA 2** - Criar uma função que se utilize de dados já gerados por modelos de previsão de deposição de nitrogênio (N) em certas regiões no mundo, e de dados ecofisiológicos sobre uso de nitrogênio em plantas arbóreas de ecossistemas diversos, e simule cenários de mudanças na composição das espécies das comunidades utilizadas no input, gerando figuras com estes cenários. A idéia é fazer previsões sobre o comportamento de espécies específicas em comunidades vegetais específicas, com base nos seus perfis de uso de N, em relação aos cenários previstos de deposição de N em áreas específicas do mundo. Seria uma forma de prever respostas de plantas à deposição de N. Por exemplo, a função seria capaz de mostrar que uma certa espécie não toleraria certo excesso de N no ambiente e apenas sobreviveria se migrasse para outra região com menor deposição, ou que esta espécie seria possivelmente extinta se tal deposição ocorresse. ====== Comentários ====== Olá Sabrina, As idéias são bacanas, mas muito ambiciosas. Estão mais para pacotes do CRAN que para função de curso! Além disso, trazem complicações teóricas muito grandes, p.ex: determinar critérios objetivos para a definição de grupos funcionais é um tema polêmico e não resolvido na literatura e tampouco metodologicamente. Não fica claro tb. como fará a inclusão da história evolutiva dos grupos (ficou muito geral e esse tb. é um desafio grande). Minha sugestão é que não se comprometa com uma proposta muito ambiciosa, com o risco de se frustar. Além disso, vamos avaliar a função pelo que vc. se comprometeu a entregar nessa proposta. Para ser bastante conservativo, sugiro que faça apenas o inicio da idéia: - a partir de dados de caracteres funcionais (morfologicos, fisiológicos...) criar uma matriz de similaridade (OU DISTÂNCIA) entre as espécies e devolver um gráfico com um cluster e a matriz, sem se comprometer com a definição dos grupos funcionais nesse momento. Sugiro também que use o indice de Gower que permite a inclusão de dados de diferentes naturezas... Veja o livro do Legendre (Numerical Ecology) ou google it ("Gower similarity index")! Veja tb. a função hclust() para grafico de cluster hierarquico. Não esqueça: MODIFIQUE A PROPOSTA PARA QUE A AVALIAÇÃO SEJA FEITA A PARTIR DESSA SIMPLIFICAÇÃO Bom trabalho! --- //[[adalardo@usp.br|Alexandre Adalardo de Oliveira]] 2013/03/25 10:11//