Esta é a referência básica para usuários de R, que inclui programas para download, listas de discussão, e muita documentação e ajuda: http://www.r-project.org/.

Explore as seções, começando pelas FAQ. Leia atentamente a seção 2 (R Basics) das FAQ.

A página tem uma grande lista de documentação, na seção Documentation. Existem excelentes manuais introdutórios feitos por vários voluntários na seção de Other em Documentation. Veja também o Task Views que são documentações com revisões das ferramentas disponíveis por área. No caso da Ecologia o Task View Environmetrics ajuda muito quem está buscando ferramentas e tem pouca experiência com o R.

Ao fim de cada aula teórica você receberá uma lista de tutoriais e exercícios que serão discutidos na aula seguinte. Por isso, providencie um computador de trabalho e instale o R nele.

Na página principal do R clique no link para o CRAN (o que é isto? veja no wiki!), e escolha o repositório mais próximo de você para baixar arquivos de instalação.

Siga as instruções das FAQS para baixar e instalar a versão mais recente do R para seu sistema operacional.

Vá à seção de pacotes adicionais do R, que te enviará para uma lista e breve descrição dos pacotes disponíveis para baixar ¹⁾. Nela você pode ter uma ideia da quantidade e diversidade de aplicações que a comunidade de usuários do R já desenvolveu. Uma visão temática destes pacotes é fornecida nas “Task Views”, cujo link está na página de pacotes.

Veja a Task view “Environmetrics” , que descreve as aplicações disponíveis para ecologia. Escolha um dos pacotes e instale em seu computador.

Abra o R em seu computador. Você verá um prompt de comando em forma de sinal de maior (>). Digite no prompt cada linha do código abaixo e tecle enter para executar. Cuidado com erros de digitação, que possivelmente gerarão erros de sintaxe, o que resultará em uma mensagem de erro.

Tente inferir o que cada comando faz a partir do resultado obtido, mas não se preocupe com detalhes. O objetivo é apenas familiarizar-se com o ambiente do R.

Discutiremos os detalhes e dúvidas nas aulas ou pode postar dúvidas no fórum da disciplina²⁾.

area <- c(303, 379, 961, 295, 332, 47,  122, 11, 53, 2749)
riqueza <- c(3, 10, 20, 7, 8, 4, 8, 3, 5, 23)
area
riqueza
summary(area)
summary(riqueza)
mean(x = area)
varea <- var(area)
varea
sqrt(varea)
sd(x = area)
mean(riqueza)
var(riqueza)
sd(riqueza)
plot(x = area, y = riqueza, xlab = "Area (ha)", ylab = "Número de Espécies")
modelo1 <- lm(riqueza ~ area)
summary(modelo1)
previsto <- fitted(modelo1)
riqueza - previsto
residuals(modelo1)
par(mfrow = c(2, 2))
plot(modelo1)
par(mfrow = c(1, 1))
plot(x = area, y = riqueza, xlab = "Area (ha)", ylab = "Número de Espécies")
abline(modelo1)
plot(x = area, y = riqueza, xlab = "Log Area (ha)", ylab = "Log Número de Espécies", log = "xy")
modelo2 <- lm(log(riqueza, base = 10) ~ log(area, base = 10))
summary(modelo2)
par(mfrow = c(2, 2))
plot(modelo2)
par(mfrow = c(1, 1))
plot(riqueza ~ area, xlab = "Log Area (ha)", ylab = "Log Número de Espécies", log = "xy")
abline(modelo2)
# O que este comando faz?
## Fim!