floristic package: unknown R Documentation Busca os nomes dos autores de espécies de angiospermas --------------------- Descrição --------------------- Esta função lê uma lista de espécies de angiospermas e retorna a mesma lista de espécies acrescida dos nomes dos autores de cada uma. -------------- Uso -------------- floristic(lista,coluna=2, bd="brasil",csv=TRUE, familia=FALSE, grafico=FALSE) ----------------- Argumentos ----------------- lista uma matriz ou um data frame de caracteres ou fator contendo a lista de espécies. Cada espécie deve estar em uma linha da mesma coluna. coluna número da coluna que contém os nomes das espécies, o defalt é 2. bd banco de dados a ser utilizados para busca. O default é um banco com os nomes das espécies de angiospermas do Brasil. Os nomes aceitos são: "brasil" (todas as plantas do Brasil), "norte" (plantas que ocorrem na região Norte do Brasil) "nordeste" (plantas que ocorrem na região Nordeste do Brasil) "centro-oeste" (plantas que ocorrem na região Centro-Oeste do Brasil) "sudeste" (plantas que ocorrem na região Sudeste do Brasil) "sul" (plantas que ocorrem na região Sul do Brasil) csv se TRUE, a função cria um arquivo de extenção CSV no seu diretório de trabalho. Note que o default é FALSE. familia se consta em lista o nome das famílias de cada espécie, então este argumento deve ser TRUE. Os nomes das famílias devem estar na primeira coluna. O default é FALSE. grafico este argumento só terá efeito se familia for TRUE. Caso seja TRUE, retornará um gráfico com as 8 famílias de maior riqueza de espécies. -------------- Detalhes -------------- É recomendada a utilização do argumento familia=TRUE para que seja possível colocar o nome das famílias de cada espécie, bem como um gráfico diagnóstico que mostra as famílias com maior riqueza. Recomenda-se fortemente retirar os "cf." ou "aff." das espécies, pois pode impedir a busca correta da espécie no banco de dados. ----------- Valor ----------- O objeto de saída é um data frame com a primeira coluna contendo o nome das famílias, a segunda coluna contendo o nome das espécies e a terceira coluna contendo um "*" onde tiver uma espécie não encontrada no banco de dados. --------- Autor: --------- Rocha, Diogo S. B. diogosbr@gmail.com ----------------- Referências ----------------- Lista de Espécies da Flora do Brasil 2013 in http://floradobrasil.jbrj.gov.br ------------------ Veja também ------------------ ######### --------------- Exemplos --------------- teste=data.frame(Família=c("Fabaceae" , "Myrtaceae" , "Asteraceae" , "Rosaceae" , "Elaeocarpaceae" , "Meliaceae" , "Bignoniaceae" , "Melastomataceae", "Lauraceae" ,"Myrtaceae" , "Sapindaceae" , "Cyatheaceae" , "Fabaceae" , "Polygonaceae" , "Melastomataceae" ,"Myrtaceae" , "Solanaceae" , "Myrtaceae", "Lauraceae" , "Myrtaceae" , "Annonaceae" ), Espécie= c("Copaifera trapaezifolia" , "Eugenia itapemirimensis" , "Vernonanthura diffusa" , "Prunus myrtifolia" , "Sloanea guianensis", "Cabralea canjerana" , "Handroanthus heptaphyllus" ,"Leandra melastomoides" , "Ocotea daphinifolia" , "Campomanesia dichotoma" , "Paullinia carpopoda" , "Alsophila setosa" , "Fabaceae sp01 " , "Cocoloba mosenii" , "Miconia tristis", "Plinia sp01" , "Solanum rupincola" , "Myrceugenia pilotantha" , "Aniba sp02" , "Eugenia sp05" , "Guatteria pogonopus" ) ) result=floristic (teste, coluna=2 ) head(result) result=floristic (teste, familia=TRUE, grafico=TRUE )