package:diversidade            R Documentation

Função para cálculos de índices de diversidades para um ou mais grupo amostral, sendo eles:
- Índice de diversidade de Shannon-Weaver (H´);
- Índice de dominância de Simpson (C)
- Índice de equabilidade de Pielou (J)

Descrição:

A função calcula os três índices mencionados, assim como o tamanho da amostra. A função permite que diferentes grupos
amostrais sejam comparados, fornecendo gráficos de cada um dos 4 valores para cada grupo amostral.

Usage:

diversidade(x)

- Onde x deve ser um dataframe com duas colunas, a primeira coluna deve ser representada pelo grupo amostral, em caso de 
apenas um grupo, a primeira coluna deve ser preenchida com um valor único

Arguments:

A função visa fornecer dados para uma melhor análise de diferentes grupos amostrais, permitindo visualizar de um modo claro os
índices relativos a análise de diversidade mais ultilizados.

Details:

Para uma melhor visualização dos dados, são apresentados os valores em gráficos, os valores gerais não está incluso no valor plotado
da média dos índices, tal medida visa que análise entre os diferentes grupos não sejam distorcidas, a função visa a análise entre os grupos
amostrais.

Value:

Os valores são apresentados em uma tabela com 5 colunas, as linhas representam os grupos amostrais, a última linha representa a análise estátisticas
considerando todos os grupos amostrais como um todo.

As colunas apresentam os valores na respectiva ordem:
- Nome do grupo amostral;
- Número de indivíduos na amostra;
- Índice de diversidade de Shannon-Weaver (H´);
- Índice de dominância de Simpson (C)
- Índice de equabilidade de Pielou (J)

A função também apresenta quatro gráficos em uma janela, sendo plotados em cada um dos gráficos os valores obtidos para cada grupo amostral, 
no sentido horário, iniciando-se do canto superior esquerdo, os gráficos representam respectivamente:

- Número de indivíduos na amostra;
- Índice de diversidade de Shannon-Weaver (H´);
- Índice de dominância de Simpson (C)
- Índice de equabilidade de Pielou (J)

     ...

Warning:

     ....

Note:

     ~~further notes~~ 

     ~Make other sections like Warning with \section{Warning }{....} ~

Author(s):

Fabricio Macedo Galvani

Msc. Student at NEAPS - UFSCAR/Sorocaba

e-mail: fmgalvani@yahoo.com.br

References:

Marguran, A. E., Ecological Diversity and Its Measurement, 1980.

Cientec, Interpretação dos Índices de Diversidade obtidos em Levantamento Fitossociológico, 2016. Disponível em: 
http://www.matanativa.com.br/br/inventario-florestal/interpretacao-dos-indices-de-diversidade-obtidos-em-levantamento-fitossociologico.html, 
Acessado em 08 de maio de 2016

See Also:

     ~~objects to See Also as 'help', ~~~

Examples:

     ##---- Should be DIRECTLY executable !! ----
     ##-- ==>  Define data, use random,
     ##--    or do  help(data=index)  for the standard data sets.