compila.ameacadas         package:nenhum       R Documentation


Compilação de listas de espécies ameaçadas

Description:

A partir de n listas de espécies ameaçadas (Lista Internacional, Lista Nacional, Listas Estaduais)realiza a compilação para que seja obtida uma lista única com as categorias de ameaças de cada uma das listas fornecidas e então gera gráficos com as proporções de espécies ameaçadas por Ordem ou Família.
 
Usage:

compila.ameacadas (x, Listas, nome.listas=NULL, filtro.ordem=NULL,       filtro.familia=NULL, filtro.especie=NULL, filtro.ca=NULL, nome.csv=NULL, grafico=TRUE)

Arguments:

x                     lista principal que será usada como base, que deve conter apenas 3 colunas: Ordem, Família e Espécie.

Listas                n listas com categorias de ameaça, que devem conter apenas 2 colunas: Espécie e Categoria de Ameaça. 

nome.listas           nome para cada lista fornecida, sendo na mesma ordem 

filtro.ordem          um vetor opcional com as Ordens para filtragem 

filtro.familia        um vetor opcional com as Famílias para filtragem

filtro.especie        um vetor opcional com as Espécies para filtragem

filtro.ca             um vetor opcional com as categorias de ameaça para filtragem

nome.csv              nome para exportar a lista compilada no formato csv (opcional) 

grafico               indica se deve gerar gráficos ou não por padrão grafico=TRUE
 

Details:

Usando as espécies da lista principal a função irá pesquisar em cada lista fornecida a presença dessas espécies e suas respectivas categorias de ameaça. 

Se nome.listas não for fornecido, as colunas de categoria de ameaça da lista retorno serão geradas com nomes genéricos.

O filtros podem ser usados de maneira combinada.


Value:

Retorna uma lista compilada com as categorias de ameaças das diferentes listas utilizadas e gráficos com as proporções das diferentes Ordens e Famílias. Essa lista pode ser importanda para um arquivo .cvs  


Author(s):

Fernanda Alves

fernandabiologia@gmail.com

References:

Crawley, M. J. 2007. The R Book. John Wiley & Sons, LTDA.


See Also:

read.table, list 


Examples:

## Uso sem filtros

teste<-compila.ameacadas(read.table("CBRO, 2009.csv", header=T, sep=";"), Lista=list(read.table("IUCN, 2012.csv", header=T, sep=";", na.strings=""),read.table("IBAMA, 2003.csv", header=T, sep=";", na.strings="")))

## Uso com filtro por Ordem e nome das listas

teste<-compila.ameacadas(read.table("CBRO, 2009.csv", header=T, sep=";"), Lista=list(read.table("IUCN, 2012.csv", header=T, sep=";", na.strings=""),read.table("IBAMA, 2003.csv", header=T, sep=";", na.strings="")), nome.listas=c("IUCN Red List","IBAMA"), filtro.ordem=c("Galliformes","Passeriformes"))