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HRpair              package:nenhum               R Documentation

Animals Home Range - Kernel. Área de Vida em pares.

Description:

       HRpair é uma função geradora de áreas de vida de casais de animais ou indivíduos que ocupam áreas próximas através de análises utilizando o estimador probabilístico não paramétrico kernel.
	A função prepara os dados concatenando diversas funções para a geração de polígonos com diversas probabilidades de ocorrência em sua área de vida.
	Hpair gera um descritivo da área de vida total e uma tabela comparativa para dois animais, com as áreas ocupadas para diversas probabilidades de ocorrência dentro desta área de vida total. Os resultados dos polígonos são apresentados em  km2.


Usage:

  HRpair<-function(indA, indB)

Arguments:

indA	caracter. Indicador do arquivo de entrada para o indivíduo 1. 

indB	caracter. Indicador do arquivo de entrada para o indivíduo 2. 
			 
 

Details:

Os arquivos de entrada devem ser uma tabela de atributos com duas colunas de coordenadas geográficas (LAT/LONG, graus decimais) separadas e nomeadas em “X” e “Y”.
A função está dividia em três partes: (1) processamento das coordenadas, (2) geração de dados espaciais, (3) geração das áreas de vida. Para tal, a função requer três pacotes (além dos pacotes básicos), relativos à execução dos comandos:
(1) PBSmapping
(2) sp
(3) adehabitatHR


Value:

  HRpair gera dois data.frames com os seguintes componentes:

	HRtotal: duas colunas de ‘homerange total’ para dois indivíduos, em km2

	HRgradual: duas colunas (indivíduo A e individuo B com graduação de áreas de vida para as probabilidades de ocorrência em 35,50,65,80 e 95%  

	
Warning:

       ...

Author:

  Rogerio Cunha de Paula
  
  Rogerio.paula@icmbio.gov.br
  rogercunha@usp.br

References:

Benhamou, S. and Riotte-Lambert, L. 2012. Beyond the Utilization Distribution: Identifying home range areas that are intensively exploited or repeatedly visited. Ecological Modelling, 227, 112-116.

Calenge, C. 2006. The package adehabitat for the R software: a tool for the analysis of space and habitat use by animals. Ecological modelling, 197, 516-519.

Pebesma, E. and Bivand, R.S. 2005. Classes and Methods for Spatial data in R. R News, 5, 9-13.

Worton, B. 1989. Kernel methods for estimating the utilization distribution in
home-range studies. Ecology, 70, 164-168.
  

See Also:


Examples:

 
  #baixar os arquivos lobomacho_exemplo.csv e lobofemea_exeplo.csv e salvar no diretório de uso do R.
  #rodar a funcao com a sintaxe a seguir

       Khr.loboscasal<-HRpair(lobomacho,lobafemea)