Diferenças

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--- 01_curso_atual:start [2022/05/16 18:48]
adalardo [Versão Não Presencial]
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-====== Curso IBUSP - 2022  ======
-<WRAP center round important 60%>
-  * Em **2022** o curso será oferecido remotamente com previsão para o período de //__06 a 27 de junho__//.
-  * Veja informações sobre [[:start#matricula|matricula]] antes de consultar os professores
-  * Veja como se dará o curso essa versão do curso não presencial no tópico a seguir.
-</WRAP>
-<WRAP center round box 60%>
-{{ youtube>QJuv1W22Rdk |}}
-----
-<wrap hi center 80%>  O período de aula em 2022 é entre os dias 06 a 27 de junho  </wrap>
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-<wrap hi center 80%>  O notar mudou para http://notar.ib.usp.br  </wrap>
-</WRAP>
-Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação e material sobre a disciplina oferecida pela programa de Pós-Graduação em Ecologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.
-===== Versão Não Presencial =====
-Devido as restrições impostas pela Covid-19, desde 2020 o curso ofical do IBUSP é oferecido de forma remota, sem atividades presenciais. O curso contará com atividades síncronas e assíncronas. Para cada um dos tópicos do curso, iremos ter as seguinte sequência de atividades:
-<WRAP center round box 90%>
-  * 1. **Aula introdutória:** encontro com aula síncrona introduzindo o tópico ou parte dele.
-  * 2. **Tutorial**: roteiro autoexplicativo com atividades associadas ao tema, acompanhado de videoaulas de 30'. Essa atividade será assistida pelos monitores e professores em um esquema de revezamento, tanto pelo __Google Meet__ quanto pelo [[http://:cursos:ecor.138098.n3.nabble.com/|fórum da disciplina]]. Continuaremos utilizando a plataforma **__Nabble__** que foi utilizada com sucesso em outros anos e que já tem um conjunto de tópicos discutidos que pode ajudar os alunos atuais.
-  * 3. **Apostila online**: material complementar ao tópico que deve ser lido e exercitado. Fazer as atividades da apostila ajuda muito na fixação e complementação da linguagem.
-  * 4. **Exercícios**: exercícios que serão submetidos à plataforma [[http://notar.ib.usp.br|notaR]], uma sistema de correção automática de exercícios e gerenciamento de notas, criado para esta disciplina.
-  * 5. **Discussão síncrona** : atividade de duração de cerca de 2 horas no __Google Meet__, mediada pela equipe da disciplina, para tirar dúvidas gerais e fazer um fechamento do tema tratado.
-</WRAP>
-<WRAP center round box 60%>
-**__Atividades Preparatórias__**
-\\
-Faça as [[pre_curso|]] até antes do início das aulas
-**__Matricula__**
-Veja informações em: [[:start#matricula|matricula]].
-</WRAP>
-===== Informações Gerais =====
-Disciplina oferecida pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia da Universidade de São Paulo
-==== Professor Responsável ====
-  * [[http://ecologia.ib.usp.br/labtrop|Alexandre Adalardo de Oliveira]], Lab. Ecologia de Florestas Tropicais //LABTROP// - IBUSP (adalardo@usp.br)
-==== Professores Colaboradores ====
-  * [[http://ecologia.ib.usp.br/let/doku.php?id=prado:start|Paulo Inácio K. L. Prado]], Laboratório de Ecologia Teórica -IBUSP   (prado@ib.usp.br)
-=== Colaboração ===
-  * Andre Chalom (notaR)
-=== Monitores ===
-/*
-  -  Bruna Cassettari
-  -  Débora Brandt
-  -  Diogo Melo
-  -  Eduarda Romanini
-  -  Felipe Campos
-  -  Gustavo Ballen
-  -  Jennifer Auler
-  -  Julia Barreto
-  -  Lucas Nascimento
-  -  Lucas Freitas
-  -  Lucas Roedel
-  -  Lucas Camacho
-  -  Pamela Santana
-  -  Rafael Melhem
-  -  Renan Del Bel
-  -  Vitor Aguiar
-  -  Vitor Rios
-  -  Vinicius Montagner
-*/
-==== Período e Horários====
-  * Disciplina condensada programada para o período de  ** 14 de setembro a 09 de outubro de 2020**.
-  * Aulas teóricas síncronas, segundas, quartas e sextas pelas manhãs, 10:00-12:00 horas.
-  * Aulas assíncronas com vídeo aulas, tutoriais e exercícios práticos: segundas, quartas e sextas 14:00-18:00 horas. Atendimento online pelo meet, durante as atividades das 16:00- 18:00h.
-  * Atendimento //assíncrono// pelo [[http://:cursos:ecor.138098.n3.nabble.com/|forum]] terças e quintas, 9:00-18:00 horas.
-==== Locais das aulas ====
-  * **Manhãs**: Aulas síncronas - Google Meet
-  * **Tardes**: Aulas assíncronas e atendimento pelo Google Meet e fórum [[http://bie5782.138098.n3.nabble.com/|Nabble]]
-=== Links para as aulas ===
-<wrap hi>[[01_curso_atual:grupos_de_aula|]]</wrap>
-/*
-Veja [[http://www.ib.usp.br/o-instituto/como-chegar.html| como chegar]].
-**Traga um //notebook// com o R instalado** veja as [[http://ecologia.ib.usp.br/:cursos:ecor/doku.php?id=01_curso_atual:pre_curso|atividades preparatórias]].
-Para os alunos de fora da USP que não tem senha de acesso à USPNet informe-se com um dos monitores.
- veja: [[uspnet2014|uspnet no minas]]
-*/
-===== Programação =====
-  *  Faça as [[pre_curso|Atividades Preparatórias]] antes do primeiro dia de aula.
-  * A disciplina consiste de aulas teóricas às segundas, quartas e sextas, seguidas de tutoriais e exercícios com o apoio dos monitores.
-  * Espera-se que as terças e quintas estejam reservadas para estudo. Nesses dias os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo [[http://:cursos:ecor.138098.n3.nabble.com/|Forum online]].
-^Primeira Semana^^^^^
-^ Data   ^Período   ^ Local ^ Assunto ^Instrutor(es)^
-|01-05/06 |livre | livre  |[[01_curso_atual:pre_curso|Atividades Preparatórias]]    | DIY |
-|06/06 |9:00-10:30| Google Meet | Introdução ao curso & Dúvidas das atividades preparatórias   | Alexandre  |
-|06/06 |11:00-16:00 |Fórum |[[:02_tutoriais:tutorial2:start|Tutorial de Funções Matemáticas]]    |Equipe  |
-|06/06 |16:00-17:30 | Google Meet |Fechamento Funções Matemáticas  | Equipe|
-|08/06 |09:00-10:30| Google Meet  | [[:02_tutoriais:tutorial3:start|Aula Leitura e Manipulação de Dados]]    | Alexandre|
-|08/06 |11:00-16:00 |Forum  | [[:02_tutoriais:tutorial3:start|Tutorial Leitura e Manipulação de Dados]]    |Equipe  |
-|08/06 |16:00-17:30| Google Meet | Fechamento Leitura e Manipulação de dados| Equipe  |
-|10/06 |09:00-10:30|Google Meet |[[:02_tutoriais:tutorial4:start|Aula Análise Exploratória de Dados]] | Alexandre |
-|10/06 |11:00-16:00 |Forum  | [[:02_tutoriais:tutorial4:start|Tutorial Análise Exploratória de Dados]]    |Equipe  |
-|10/06 |16:00-17:30| Google Meet | Fechamento Análise Exploratória de Dados| Equipe  |
-^Segunda Semana^^^^^
-^ Data   ^Período   ^ Local ^ Assunto ^Instrutor(es)^
-|13/06 |9:00-10:30| Google Meet | [[:02_tutoriais:tutorial5:start|Aula Gráficos I]]   |Alexandre |
-|13/06 |11:00-16:00 |Fórum |[[:02_tutoriais:tutorial5:start|Tutorial de Gráficos I]]    |Equipe  |
-|13/06 |16:00-17:30 | Google Meet |Fechamento Gráficos I  | Equipe|
-|15/06 |09:00-10:30| Google Meet  | [[:02_tutoriais:tutorial5b:start| Aula Gráficos II]]     |Alexandre  |
-|15/06 |11:00-16:00 |Forum | [[:02_tutoriais:tutorial5b:start|Tutorial  Gráficos II]]    |Equipe  |
-|15/06 |16:00-17:30| Google Meet | Fechamento Gráficos| Equipe  |
-|17/06 |09:00-10:30|Google Meet |[[:02_tutoriais:tutorial6:start|Teste de Significância]] | Alexandre  |
-|17/06 |11:00-16:00 |Forum  | [[:02_tutoriais:tutorial6:start| Tutorial Teste de Significância]]   |Equipe  |
-|17/06 |16:00-17:30| Google Meet |Fechamento Teste de Significância| Equipe  |
-^Terceira Semana^^^^^
-^ Data   ^Período   ^ Local ^ Assunto ^Instrutor(es)^
-|20/06 |9:00-10:30| Google Meet |  [[:02_tutoriais:tutorial7:start| Aula de Modelos Lineares]]    |Alexandre  |
-|20/06 |11:00-16:00 |Fórum | [[:02_tutoriais:tutorial7:start|Tutorial de Modelos Lineares]]  |Equipe  |
-|20/06 |16:00-17:30 | Google Meet |Fechamento Modelos Lineares | Equipe|
-|22/06 |09:00-10:30| Google Meet  |[[02_tutoriais:tutorial7b:start|Aula Modelos Lineares Multiplos]]    |Alexandre  |
-|22/06 |11:00-16:00 |Forum | [[02_tutoriais:tutorial7b:start|Tutorial Modelos Lineares Multiplos]]    |Equipe  |
-|22/06 |16:00-17:30| Google Meet |Fechamento Modelos Lineares| Equipe  |
-|24/06 |09:00-10:30|Google Meet |[[:02_tutoriais:tutorial9:start|Aula Reamostragem]] | Alexandre  |
-|24/06 |11:00-16:00 |Forum  | [[:02_tutoriais:tutorial9:start|Tutorial Reamostragem]]   |Equipe  |
-|24/06 |16:00-17:30| Google Meet | Fechamento Reamostragem| Equipe  |
-^Quarta Semana^^^^^
-^ Data   ^Período   ^ Local ^ Assunto ^Instrutor(es)^
-|27/06 |09:00-10:30|Google Meet |[[:02_tutoriais:tutorial8:start|Aula Funções]] | Alexandre  |
-|27/06 |11:00-16:00 |Forum  | [[:02_tutoriais:tutorial8:start|Tutorial Funções]]   |Equipe  |
-|27/06 |16:00-17:30| Google Meet | Fechamento Curso| Equipe  |
-/*
-^Quarta Semana^^^^^
-^ Data   ^Período   ^ Local ^ Assunto ^Instrutor(es)^
-|13/05 |9:00-10:30| Auditório 2 |Filosofia e histórico da linguagem R   |Professores|
-|13/05 |11:00-12:30| Auditório 2I | Introdução à linguagem R  |Equipe|
-|13/05 |14:00-15:30|Anatomia |Tira Dúvidas das atividades preparatórias   |Professores e monitores  |
-|13/05 |16:00-18:00 |Sala multimídia CD |Tutorial de Funções Matemáticas    | Equipe  |
-|14/05 |9:00-18:00 |Forum //online//   |Plantão funções Matemáticas  | Monitores  & Professores|
-|16/05 |9:00-10:30| Auditório 2|Dúvidas Funções Matemáticas   |Professores  |
-|16/05 |11:00-12:30| Auditório 2 | Leitura e Manipulação de Dados   |Equipe  |
-|16/05 |14:00-18:00 |Sala multimídia CD |Tutorial Manipulação de Dado   |Monitores   |
-|17/05 |9:00-12:30| AG Zoologia |Análise Exploratória de Dados| Professores  |
-|17/05 |14:00-16:00| Sala multimídia CD  | Tutorial Análise Exploratória de Dados | Monitores & Professores |
-^Segunda Semana^^^^^
-|20/05 |9:00-9:30| Auditório 2|Tira Dúvidas  |Professores |
-|20/05 |9:30-12:30|Auditório 2|Gráficos|Equipe|
-|20/05 |14:00-18:00 |Anatomia - Multimídea 2 |Tutorial Gráficos  |Monitores |
-|22/05  |9:00-12:30|Auditório 2 |Teste de Hipótese  |Alexandre|
-|22/05  |14:00-18:00 |Sala multimídia CD |Teste de Hipótese |Monitores |
-|24/05  |9:00-9:30| AG - Zoologia |Tira Dúvidas Teste de Hipótese   |Professores  |
-|24/05  |9:30-12:30| AG - Zoologia  | Regressão Linear |Alexandre|
-|24/05  |14:00-18:00 |Sala multimídia CD  |Tutorial Regressão Linear  |Monitores |
-^Terceira Semana^^^^^
-|27/05 |9:00-12:30|Auditório 2 |Regressão Linear II  |Professores  |
-|27/05 |14:00-18:00 | Anatomia - Multimídia II |Tutorial Regressão Linear II  |Monitores |
-|29/05 |9:00-12:30|Auditório 2|Simulação e Permutação |Alexandre|
-|29/05 |14:00-18:00 |Anatomia - Multimídia II  |tutorial Simulação e Permutação   |Professores |
-|31/05 |9:00-12:30|AG da Zoologia|Noções de Programação em Linguagem R: construção de funções simples   |Professores|
-|31/05 |14:00- 18:00 |Sala multimídia CD |Tutorial Programação |Monitores |
-*/
-===== Bibliografia Básica=====
-<WRAP center round box 60%>
-A quantidade de material disponível sobre programação em R é muito extensa. Aqui apresentamos uma compilação da documentação oficial que consideramos mais importante e algumas fontes que avaliamos ser mais interessante.
-Para os que acompanham cursos online, indicamos o curso de [[https://www.coursera.org/course/rprog|programação em R]] no Coursera oferecido pela [[https://www.coursera.org/jhu|Johns Hopkins University]].
-</WRAP>
-==== Livros ====
-**William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002.**
-Conhecido na comunidade R como //"The Book"//, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o ''MASS''((este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN)), que faz parte da instalação básica do R. Visite o [[http://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS4/|site]] do livro para atualizações, exercícios e muito mais.
-**John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002.**
-Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, ''car'', tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o [[http://socserv.socsci.mcmaster.ca/jfox/Books/Companion/index.html|site]] do livro.
-**John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005.** Derivado de manual [[http://www.math.csi.cuny.edu/Statistics/R/simpleR/printable/simpleR.pdf|disponível gratuitamente]] no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o [[http://wiener.math.csi.cuny.edu/UsingR/|site]] do livro, e o pacote **usingR**.
-**Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007.** Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o [[http://www.bio.ic.ac.uk/research/mjcraw/therbook/index.htm/|site]] do livro.
-==== Documentação On Line ====
-**NOTA:** Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção [[http://cran.r-project.org/other-docs.html|Contributed Documentation]] do site do R.
-**Venables, W.; Smith, D.M; & R Development Team  **  [[http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf|An Introduction to R. Manual online]]. Manual oficial de introdução ao R.
-**Carlos Alzola and Frank E. Harrell [[http://cran.r-project.org/doc/contrib/Alzola+Harrell-Hmisc-Design-Intro.pdf|An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries]]” ** O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.
-**Petra Kuhnert and Bill Venables [[http://cran.r-project.org/doc/contrib/Kuhnert+Venables-R_Course_Notes.zip|An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing]].** Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.
-==== Veja também ====
-Duas dicas do monitor Vitor Rios:
-  * [[http://www.computerworld.com/article/2497143/business-intelligence-beginner-s-guide-to-r-introduction.html?null| Beginner's guide to R]] - uma breve introdução sobre a linguagem publicada na revista online //ComputerWorld//. Um guia compacto sobre tópicos básicos.
-  *[[http://adv-r.had.co.nz| Advanced R]]. Compilação online do livro de mesmo nome de autoria de Hadley Wickham. Descrição do publico alvo, pelo autor: //"The book is designed primarily for R users who want to improve their programming skills and understanding of the language."//
-==== Outros Recursos ====
-  * [[https://swirlstats.com/|swiRl]]: pacote com curso interativo no próprio console do R.
-  * **//[[https://cran.r-project.org/web/views/|Taskviews]]//**:  são listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no [[http://cran.r-project.org/mirrors.html|CRAN]]((Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R)). Para nossa área, p.ex, há os //views// //Environmetrics//, //Multivariate//, //Genetics//, //Spatial//. Todo espelho de [[http://cran.r-project.org/mirrors.html|CRAN]] mantém uma cópia dos //taskviews//. Para o espelho da FMV-USP o link é [[http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/]].
-  * [[http://journal.r-project.org/|The R Journal]]: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
-  * [[http://www.jstatsoft.org|Journal of Statistical Software]]: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre [[http://www.jstatsoft.org/v22|uso do R em ecologia]], e outro sobre [[http://www.jstatsoft.org/v24|análises de redes]] (com ênfase para dados de ciências sociais).
-  * [[http://www.statmethods.net/index.html|Quick R]], de Rob Kabakoff: um guia rápido //on line// muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
-  * [[http://en.wikibooks.org/wiki/R_Programming|The R Wikibook]]: manual muito completo na coleção de [[http://en.wikibooks.org/wiki/Main_Page|Wiki Books]].

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