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01_curso_atual:usor
Diferenças
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01_curso_atual:usor [2022/05/17 09:32] adalardo [Explore a Página Oficial do R] |
01_curso_atual:usor [2023/08/11 12:17] |
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| - | ====== Usando o R ====== | ||
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| - | ==== Explore a Página Oficial do R==== | ||
| - | {{:01_curso_atual:Rlogo.png?300 |}} | ||
| - | Esta é a referência básica para usuários de R, que inclui programas para download, listas de discussão, e muita documentação e ajuda: [[http://www.r-project.org/]]. | ||
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| - | Explore as seções, começando pelas FAQ. Leia atentamente a seção 2 ([[https://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html#R-Basics|R Basics]]) das FAQ. | ||
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| - | A página tem uma grande lista de documentação, na seção **__Documentation__**. Existem excelentes manuais introdutórios feitos por vários voluntários na seção de [[http://cran.r-project.org/other-docs.html|Other ]]em **__Documentation__**. | ||
| - | Veja também o [[https://vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/|Task Views]] que são documentações com revisões das ferramentas disponíveis por área. No caso da Ecologia o Task View [[https://cran.r-project.org/web/views/Environmetrics.html|Environmetrics]] | ||
| - | ajuda muito a quem está buscando ferramentas e tem pouca experiência com o R. | ||
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| - | ==== Instale o R em seu Computador de Trabalho ==== | ||
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| - | Ao fim de cada aula teórica você receberá uma lista de tutoriais e exercícios que serão discutidos na aula seguinte. Por isso, providencie um computador de trabalho e instale o R nele. | ||
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| - | Na página principal do R clique no link para o CRAN (o que é isto? veja [[http://cran.r-project.org/doc/FAQ/R-FAQ.html#What-is-CRAN_003f|no wiki!]]), e escolha o repositório mais próximo de você para baixar arquivos de instalação. | ||
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| - | Siga as instruções das FAQS para baixar e instalar a versão mais recente do R para seu sistema operacional. | ||
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| - | Vá à seção de pacotes adicionais do R, que te enviará para uma lista e breve descrição dos pacotes disponíveis para baixar ((mais de 10.400 em abril de 2017!)). Nela você pode ter uma ideia da quantidade e diversidade de aplicações que a comunidade de usuários do R já desenvolveu. Uma visão temática destes pacotes é fornecida nas "Task Views", cujo link está na página de pacotes. | ||
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| - | Veja a Task view "Environmetrics" , que descreve as aplicações disponíveis para ecologia. Escolha um dos pacotes e instale em seu computador. | ||
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| - | <WRAP center round box 60%> | ||
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| - | Para aqueles que utilizam o sistema operacional Linux há um bom tutorial para instalação do R disponível em [[http://labtrop.ib.usp.br/doku.php?id=dicas_mat_apoio:programas:instalarunbutu| dicas Labtrop Instalar o R no Linux]] | ||
| - | </WRAP> | ||
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| - | ==== Familiarize-se com o R==== | ||
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| - | Abra o R em seu computador. Você verá um ''prompt'' de comando em forma de sinal de maior (''>''). Digite no ''prompt'' cada linha do código abaixo e tecle ''enter'' para executar. Cuidado com erros de digitação, que possivelmente gerarão erros de sintaxe, o que resultará em uma mensagem de erro. | ||
| - | |||
| - | <WRAP center round box 60%> | ||
| - | //**__Preso no R__**// | ||
| - | Um erro comum é teclar ''enter'' antes de finalizar corretamente o comando (falta de '**, **' , '**)**'...). | ||
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| - | Nesse casos o ''prompt'' ficará esperando a finalização do comando e não aparecerá mais o sinal de ''>'' na linha. Nesses casos use a tecla ''Esc'' para abortar o comando e voltar ao ''>''. | ||
| - | </WRAP> | ||
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| - | Tente inferir o que cada comando faz a partir do resultado obtido, mas não se preocupe com detalhes. O objetivo é apenas familiarizar-se com o ambiente do R. | ||
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| - | Discutiremos os detalhes e dúvidas nas aulas ou pode postar dúvidas no fórum da disciplina((link na barra lateral à esquerda)). | ||
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| - | <code rsplus> | ||
| - | area <- c(303, 379, 961, 295, 332, 47, 122, 11, 53, 2749) | ||
| - | riqueza <- c(3, 10, 20, 7, 8, 4, 8, 3, 5, 23) | ||
| - | area | ||
| - | riqueza | ||
| - | summary(area) | ||
| - | summary(riqueza) | ||
| - | mean(x=area) | ||
| - | varea <- var(area) | ||
| - | varea | ||
| - | sqrt(varea) | ||
| - | sd(x=area) | ||
| - | mean(riqueza) | ||
| - | var(riqueza) | ||
| - | sd(riqueza) | ||
| - | plot(x=area, y=riqueza, xlab="Area (ha)", ylab="Número de Espécies") | ||
| - | modelo1 <- lm(riqueza~area) | ||
| - | summary(modelo1) | ||
| - | previsto <- fitted(modelo1) | ||
| - | riqueza - previsto | ||
| - | residuals(modelo1) | ||
| - | par(mfrow=c(2,2)) | ||
| - | plot(modelo1) | ||
| - | par(mfrow=c(1,1)) | ||
| - | plot(x=area, y=riqueza, xlab="Area (ha)", ylab="Número de Espécies") | ||
| - | abline(modelo1) | ||
| - | plot(x=area, y=riqueza, xlab="Log Area (ha)", ylab="Log Número de Espécies", log="xy") | ||
| - | modelo2 <- lm(log(riqueza,base=10)~log(area,base=10)) | ||
| - | summary(modelo2) | ||
| - | par(mfrow=c(2,2)) | ||
| - | plot(modelo2) | ||
| - | par(mfrow=c(1,1)) | ||
| - | plot(riqueza~area, xlab="Log Area (ha)", ylab="Log Número de Espécies", log="xy") | ||
| - | abline(modelo2) | ||
| - | # O que este comando faz? | ||
| - | ## Fim! | ||
| - | </code> | ||
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01_curso_atual/usor.txt · Última modificação: 2023/08/11 12:17 (edição externa)
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