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03_apostila:01-intro [2020/08/12 06:04] 127.0.0.1 edição externa |
03_apostila:01-intro [2020/08/20 16:09] adalardo |
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====== 1. Introdução ====== | ====== 1. Introdução ====== | ||
Linha 64: | Linha 64: | ||
Em ambiente UNIX (como o Linux, por exemplo), podemos iniciar o R a partir do interpretador de comandos (//shell//) digitando o comando ''R'': | Em ambiente UNIX (como o Linux, por exemplo), podemos iniciar o R a partir do interpretador de comandos (//shell//) digitando o comando ''R'': | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
parsival@jatai $ R | parsival@jatai $ R | ||
</code> | </code> | ||
Linha 72: | Linha 72: | ||
Independentemente de como inicia, o R apresenta uma tela com (aproximadamente) a seguinte forma: | Independentemente de como inicia, o R apresenta uma tela com (aproximadamente) a seguinte forma: | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
R version 2.7.0 (2008-04-22) | R version 2.7.0 (2008-04-22) | ||
Copyright (C) 2008 The R Foundation for Statistical Computing | Copyright (C) 2008 The R Foundation for Statistical Computing | ||
Linha 108: | Linha 108: | ||
O estado de espera ocorre quando o usuário envia um comando incompleto, o que é indicado por um sinal de "''+''": | O estado de espera ocorre quando o usuário envia um comando incompleto, o que é indicado por um sinal de "''+''": | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> | > | ||
> log(2 | > log(2 | ||
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Como nos exemplos abaixo: | Como nos exemplos abaixo: | ||
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> plot(x=area,y=riqueza) | > plot(x=area,y=riqueza) | ||
> plot(area, riqueza) | > plot(area, riqueza) | ||
Linha 168: | Linha 168: | ||
Há, portanto, três maneiras de guardar os resultados de um comando em um objeto: | Há, portanto, três maneiras de guardar os resultados de um comando em um objeto: | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> a <- sqrt(4) | > a <- sqrt(4) | ||
> b = sqrt(4) | > b = sqrt(4) | ||
Linha 175: | Linha 175: | ||
Para exibir o conteúdo de um objeto, basta digitar seu nome | Para exibir o conteúdo de um objeto, basta digitar seu nome | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> a | > a | ||
[1] 2 | [1] 2 | ||
Linha 186: | Linha 186: | ||
Se a atribuição é para um objeto que não existe, esse objeto é criado. **Mas cuidado**: se já há um objeto com o mesmo nome na sua área de trabalho, seus valores serão substituídos: | Se a atribuição é para um objeto que não existe, esse objeto é criado. **Mas cuidado**: se já há um objeto com o mesmo nome na sua área de trabalho, seus valores serão substituídos: | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> a <- sqrt(4) | > a <- sqrt(4) | ||
> a | > a | ||
Linha 199: | Linha 199: | ||
==== Mensagens de Erro e de Avisos ==== | ==== Mensagens de Erro e de Avisos ==== | ||
Como em qualquer linguagem, o R tem regras de sintaxe e grafia. Mas contrário das linguagens humanas, mesmo um pequeno erro torna a mensagem incompreensível para o R, que então retorna uma mensagem de erro: | Como em qualquer linguagem, o R tem regras de sintaxe e grafia. Mas contrário das linguagens humanas, mesmo um pequeno erro torna a mensagem incompreensível para o R, que então retorna uma mensagem de erro: | ||
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> logaritmo(2) | > logaritmo(2) | ||
Erro: não foi posssível encontrar a função "logaritmo" | Erro: não foi posssível encontrar a função "logaritmo" | ||
Linha 211: | Linha 211: | ||
Em outros casos, o comando pode ser executado, mas com um resultado que possivelmente você não desejava. O R cria mensagens de alerta para os casos mais comuns desses resultados que merecem atenção : | Em outros casos, o comando pode ser executado, mas com um resultado que possivelmente você não desejava. O R cria mensagens de alerta para os casos mais comuns desses resultados que merecem atenção : | ||
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> log(-2) | > log(-2) | ||
[1] NaN | [1] NaN | ||
Linha 223: | Linha 223: | ||
Para sair do R, a forma mais fácil é usar o comando ''q'' (do inglês //quit//). Nesse caso o R, lhe pergunda se você deseja //salvar// (gravar) | Para sair do R, a forma mais fácil é usar o comando ''q'' (do inglês //quit//). Nesse caso o R, lhe pergunda se você deseja //salvar// (gravar) | ||
sua sessão de trabalho. | sua sessão de trabalho. | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> q() | > q() | ||
Save workspace image? [y/n/c]: | Save workspace image? [y/n/c]: | ||
Linha 243: | Linha 243: | ||
O diretório a partir do qual você iniciou o R é o **diretório de trabalho** dessa sessão. Para verificar seu diretório de trabalho, use o comando ''getwd''((acrônimo de "get working directory")): | O diretório a partir do qual você iniciou o R é o **diretório de trabalho** dessa sessão. Para verificar seu diretório de trabalho, use o comando ''getwd''((acrônimo de "get working directory")): | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> getwd() | > getwd() | ||
[1] "/home/paulo/work/Pos_grad/Eco_USP/cursoR" | [1] "/home/paulo/work/Pos_grad/Eco_USP/cursoR" | ||
Linha 250: | Linha 250: | ||
Para alterar o diretório de trabalho há a função ''setwd'': | Para alterar o diretório de trabalho há a função ''setwd'': | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> setwd("/home/paulo/work/treinos_R/") | > setwd("/home/paulo/work/treinos_R/") | ||
> getwd() | > getwd() | ||
Linha 267: | Linha 267: | ||
Se acontecer do computador ser desligado durante uma sessão do R, tudo que foi feito será perdido!!! | Se acontecer do computador ser desligado durante uma sessão do R, tudo que foi feito será perdido!!! | ||
Para evitar isso, é interessante gravar com frequência o **workspace** utilizando o comando '''save.image()''': | Para evitar isso, é interessante gravar com frequência o **workspace** utilizando o comando '''save.image()''': | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> save.image() | > save.image() | ||
> | > | ||
Linha 274: | Linha 274: | ||
Por //default//, o R gravará o workspace no arquivo ''.RData'', e quando você reiniciar uma sessão, o R automaticamente **carrega** esse arquivo. | Por //default//, o R gravará o workspace no arquivo ''.RData'', e quando você reiniciar uma sessão, o R automaticamente **carrega** esse arquivo. | ||
Mas você pode salvar em outro arquivo utilizando o **argumento** ''file'' da função: | Mas você pode salvar em outro arquivo utilizando o **argumento** ''file'' da função: | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> save.image(file="minha-sessao-introdutoria.RData") | > save.image(file="minha-sessao-introdutoria.RData") | ||
> | > | ||
Linha 281: | Linha 281: | ||
Como o R carrega automaticamente apenas o arquivo ''.RData'' que está no diretório de trabalho, caso deseje carregar outros arquivos você deverá usar a função ''load'': | Como o R carrega automaticamente apenas o arquivo ''.RData'' que está no diretório de trabalho, caso deseje carregar outros arquivos você deverá usar a função ''load'': | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
># Carrega um arquivo de workspace no mesmo diretório | ># Carrega um arquivo de workspace no mesmo diretório | ||
> load(file="minha-sessao-introdutoria.RData") | > load(file="minha-sessao-introdutoria.RData") | ||
Linha 292: | Linha 292: | ||
Se você quiser salvar apenas alguns objetos (digamos, os resultados das suas análises), você pode usar o comando ''save'': | Se você quiser salvar apenas alguns objetos (digamos, os resultados das suas análises), você pode usar o comando ''save'': | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> save(modelo1, file="meu_modelo.RData") | > save(modelo1, file="meu_modelo.RData") | ||
> save(dados, modelo1, modelo2, file="meus_modelos.RData") | > save(dados, modelo1, modelo2, file="meus_modelos.RData") | ||
Linha 300: | Linha 300: | ||
O comando ''save'' aceita o resultado de outros comandos. Por exemplo, o código abaixo equivale ao comando save.image(): | O comando ''save'' aceita o resultado de outros comandos. Por exemplo, o código abaixo equivale ao comando save.image(): | ||
- | <code> | + | <code rsplus> |
> save (list=ls(), file="tudo.RData") | > save (list=ls(), file="tudo.RData") | ||
</code> | </code> | ||
Linha 522: | Linha 522: | ||
Após esta mensagem, um portal de ajuda em hipertexto será aberto no navegador de internet padrão do sistema. A partir dessa página inicial é possível fazer pesquisas por palavras-chave, consultar funções por pacote ou por ordem alfabética, obter textos introdutórios sobre a linguagem, e muito mais. | Após esta mensagem, um portal de ajuda em hipertexto será aberto no navegador de internet padrão do sistema. A partir dessa página inicial é possível fazer pesquisas por palavras-chave, consultar funções por pacote ou por ordem alfabética, obter textos introdutórios sobre a linguagem, e muito mais. | ||
<WRAP center round box 560px> | <WRAP center round box 560px> | ||
- | {{:cursos:ecor:03_apostila:fetch.png?550|}} | + | {{:03_apostila:fetch.png?550|}} |
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Linha 691: | Linha 691: | ||
===== Primeiros Passos ===== | ===== Primeiros Passos ===== | ||
- | Siga para o tópico [[cursos:ecor:03_apostila:02-entrada]] da apostila e faça as atividades ali descritas. | + | Siga para o tópico [[03_apostila:02-entrada]] da apostila e faça as atividades ali descritas. |
===== Atividade Extra ===== | ===== Atividade Extra ===== | ||
Linha 709: | Linha 709: | ||
[[http://lmq.esalq.usp.br/CRAN/doc/manuals/R-intro.pdf|Venables, W.N.; Smith, D.M.; R Development Core Team]] //An Introduction to R - Notes on R: a programming environment for data analysis and graphics//. Version 2.5.1 (2007-06-27). | [[http://lmq.esalq.usp.br/CRAN/doc/manuals/R-intro.pdf|Venables, W.N.; Smith, D.M.; R Development Core Team]] //An Introduction to R - Notes on R: a programming environment for data analysis and graphics//. Version 2.5.1 (2007-06-27). | ||
- | Matéria sobre o R no New York Times, Janeiro de 2009: [[http://www.nytimes.com/2009/01/07/technology/business-computing/07program.html?pagewanted=1&_r=3&emc=eta1#|matéria on-line]], {{:cursos:ecor:03_apostila:r_on_ny_time_jan_2009.pdf| versão pdf}} | + | Matéria sobre o R no New York Times, Janeiro de 2009: [[http://www.nytimes.com/2009/01/07/technology/business-computing/07program.html?pagewanted=1&_r=3&emc=eta1#|matéria on-line]], {{:03_apostila:r_on_ny_time_jan_2009.pdf| versão pdf}} |
//Publish your code - it is good enough//, por Nick Barnes: um ensaio que estimula pesquisadores a partilharem seus códigos de análise de dados, mesmo que pareçam imperfeitos. [[http://www.nature.com/news/2010/101013/full/467753a.html|artigo na Nature News]], 2010. | //Publish your code - it is good enough//, por Nick Barnes: um ensaio que estimula pesquisadores a partilharem seus códigos de análise de dados, mesmo que pareçam imperfeitos. [[http://www.nature.com/news/2010/101013/full/467753a.html|artigo na Nature News]], 2010. |