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05_curso_antigo:r2019:alunos:trabalho_final:maributti:start [2020/08/12 06:04] 127.0.0.1 edição externa |
05_curso_antigo:r2019:alunos:trabalho_final:maributti:start [2020/09/23 17:15] adalardo link |
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| - | {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:mari_emas.jpg?300|}} | + | {{:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:mari_emas.jpg?300|}} |
| Analista Ambiental do Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade atuando no Centro de Pesquisa e Conservação de Mamíferos Carnívoros. Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Minas Gerais (2008). Tem experiência na área de Zoologia, Geoprocessamento e Gestão de Unidades de Conservação. Atualmente é mestranda em Conservação da Biodiversidade e Desenvolvimento Sustentável pela Escola Superior de Conservação Ambiental e Sustentabilidade - IPÊ/ESCAS. | Analista Ambiental do Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade atuando no Centro de Pesquisa e Conservação de Mamíferos Carnívoros. Possui graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Federal de Minas Gerais (2008). Tem experiência na área de Zoologia, Geoprocessamento e Gestão de Unidades de Conservação. Atualmente é mestranda em Conservação da Biodiversidade e Desenvolvimento Sustentável pela Escola Superior de Conservação Ambiental e Sustentabilidade - IPÊ/ESCAS. | ||
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| A marcação e recaptura é um método clássico de estimar populações animais. Esse baseia-se na proporção entre indivíduos marcados e não marcados nas recapturas para estimar a população total. | A marcação e recaptura é um método clássico de estimar populações animais. Esse baseia-se na proporção entre indivíduos marcados e não marcados nas recapturas para estimar a população total. | ||
| - | <code> | + | <code rsplus> |
| Y<- M*(t/m) | Y<- M*(t/m) | ||
| </code> | </code> | ||
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| Entretanto, se essa premissa puder ser testada comparando os dados coletados com distribuições uniformes e agregadas, pode-se decidir pelo uso ou não das estimativas populacionais geradas com o método. | Entretanto, se essa premissa puder ser testada comparando os dados coletados com distribuições uniformes e agregadas, pode-se decidir pelo uso ou não das estimativas populacionais geradas com o método. | ||
| - | A função deverá estimar as populações de animais {{:bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv|usando dados de uma tabela de contagens de indivíduos total e marcados em vídeos obtidos por armadilhamento fotográfico}}. A função permite gerar estimativas por simulações de Monte Carlo usando a soma de todos os registros. | + | A função deverá estimar as populações de animais {{:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv|usando dados de uma tabela de contagens de indivíduos total e marcados em vídeos obtidos por armadilhamento fotográfico}}. A função permite gerar estimativas por simulações de Monte Carlo usando a soma de todos os registros. |
| - | <code> | + | <code rsplus> |
| p<- sum(t)/sum(m) | p<- sum(t)/sum(m) | ||
| Y<- M*p | Y<- M*p | ||
| Linha 200: | Linha 200: | ||
| - | <code> | + | <code rsplus> |
| socialmr<-function(marked, # numero total de individuos marcados no estudo (classe: integer, marked > 0) | socialmr<-function(marked, # numero total de individuos marcados no estudo (classe: integer, marked > 0) | ||
| n.mark, #vetor de numero individuos marcados no registro (classe: integer, n.mark > 0) | n.mark, #vetor de numero individuos marcados no registro (classe: integer, n.mark > 0) | ||
| Linha 337: | Linha 337: | ||
| - | <code> | + | <code rsplus> |
| socialmr package:nenhum R Documentation | socialmr package:nenhum R Documentation | ||
| Linha 443: | Linha 443: | ||
| ##Teste da funcao com os dados reais | ##Teste da funcao com os dados reais | ||
| - | a <-read.table("http://ecologia.ib.usp.br/bie5782/lib/exe/fetch.php?media=bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv", sep=" ", header =TRUE, as.is=TRUE) | + | a <-read.table("http://ecologia.ib.usp.br/bie5782/lib/exe/fetch.php?media=01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv", sep=" ", header =TRUE, as.is=TRUE) |
| socialmr(marked=741, n.mark=a$mark_m, n.total = a$total_n, site=a$ID_cam, teste="anova") | socialmr(marked=741, n.mark=a$mark_m, n.total = a$total_n, site=a$ID_cam, teste="anova") | ||
| ##Teste da função com dados agregados | ##Teste da função com dados agregados | ||
| - | a <-read.table("http://ecologia.ib.usp.br/bie5782/lib/exe/fetch.php?media=bie5782:01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv", sep=" ", header =TRUE, as.is=TRUE) | + | a <-read.table("http://ecologia.ib.usp.br/bie5782/lib/exe/fetch.php?media=01_curso_atual:alunos:trabalho_final:maributti:camtrap.csv", sep=" ", header =TRUE, as.is=TRUE) |
| socialmr(marked=741, n.mark=a$mark_agg, n.total = a$total_n, site=a$ID_cam, hist.curv=FALSE) | socialmr(marked=741, n.mark=a$mark_agg, n.total = a$total_n, site=a$ID_cam, hist.curv=FALSE) | ||
05_curso_antigo/r2019/alunos/trabalho_final/maributti/start.txt · Última modificação: 2020/09/23 17:15 por adalardo
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