Avaliação
Cada aluno deverá fazer o exercício abaixo para a avaliação final da disciplina. O exercício corresponde a atividades relacionadas a nossas aulas iniciais, principalmente aos temas de leitura de arquivos e manipulação e análise exploratória dos dados.
Siga o roteiro abaixo e prepare o script comentado de todos os passos que efetuou no R. Salve seu script em um arquivo com seu nome (ex: beto.r) e encaminhe para os emails dos professores (vicentini.beto@gmail.com e aleRcurso@gmail.com) até dia 26 de outubro de 2012.
- defina seu diretório de trabalho e baixe o arquivo de dados do wiki que corresponde ao seu nome e salve no seu diretório de trabalho. Os arquivos contem dados simulados respresentando dados biológicos de espécies em diferentes localidades.
Dados Alunos
| nome aluno | arquivo |
|---|---|
| Eduardo | dadosaluno_01.csv |
| Dirce | dadosaluno_02.csv |
| Nathan | dadosaluno_03.csv |
| Ieda | dadosaluno_04.csv |
| Ana | dadosaluno_05.csv |
| Priscila | dadosaluno_06.csv |
| Bruno | dadosaluno_07.csv |
| Michelly | dadosaluno_08.csv |
| Deyla | dadosaluno_09.csv |
| Emanuell | dadosaluno_010.csv |
| Ordilena | dadosaluno_011.csv |
| Miguel | dadosaluno_012.csv |
| Flavia | dadosaluno_013.csv |
- leia os dados no R e confira se eles foram lidos corretamente. Os dados devem conter: 4 variáveis de caracteres, e duas variáveis numéricas. Atenção, as colunas com caracteres não devem ser lidas como fator. As variáveis representam:
- parcsp: código da parcela (localidade)
- habsp: habitat correspondente a parcela
- nomegn: código do gênero
- nomesp: código da espécie
- dap: diâmetro a altura do peito (cm)
- h: altura do fuste principal (m)
- confira a estrutura e a dimensão dos dados
- conte gêneros e espécies;
- conte gêneros e espécies por parcela;
- qual o número de espécies por gênero;
- calcule o número médio de espécies por parcela;
- crie um vetor de indice para os valores de dap ordenados de forma decrescente (função order()). Use esse vetor para ordenar o objeto de dados de forma a visualizar a espécie com maior diâmetro;
- calcule o diâmetro máximo por espécie e habitat;
- crie uma tabela contendo as espécies como linhas e parcelas como colunas, contendo o número de indivíduos de cada espécie por parcela;
- converta essa tabela em um data frame;
- a partir do data frame produzido acima, conte a ocorrência das espécies (número de parcelas que ela ocorre);
- calcule a altura máxima por espécie;
- caso haja algum dado não disponível na variável altura, substitua pela relação alométrica h= 20 + 0.2* dap
- para a espécie mais abundante nos seus dados, faça um gráfico de caixa (boxplot) da distribuição do diâmetro nos diferentes ambientes;
- faça um gráfico da relação entre diâmetro (eixo x) e altura (eixo y), coloque legenda e aumente o tamanho dos pontos e das legendas dos eixos em 1.2;
- desenho no gráfico acima a linha represtada pela função y= 20 + 0.2*x (dica: função abline())
- SALVE SEU SCRIPT