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Curso IBUSP - 2022

  • Em 2022 o curso será oferecido remotamente com previsão para o período de 06 a 27 de junho.
  • Se está matriculado na discipina deve fazer as Atividades Preparatórias antes do inicio do curso.
  • Veja informações sobre matricula antes de consultar os professores.
  • O vídeo abaixo descreve como foi o esquema da disciplina remota em 2020. Este ano a disciplina ainda será remota e iremos seguir, em parte, esse mesmo esquema. Assista para ter uma ideia de como se dará.

O período de aula em 2022 é entre os dias 06 a 27 de junho


O fórum Nabble foi desativado e não iremmos mais usá-lo. Para a turma de 2022 utilizaremos o fórum do moodle oficial da USP (e-disciplinas)


O notar mudou para http://notar.ib.usp.br

Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação e material sobre a disciplina oferecida pela programa de Pós-Graduação em Ecologia do Instituto de Biociências da Universidade de São Paulo.

Versão Não Presencial

Devido as restrições impostas pela Covid-19, desde 2020 o curso ofical do IBUSP é oferecido de forma remota, sem atividades presenciais. O curso contará com atividades síncronas e assíncronas. Para cada um dos tópicos do curso, iremos ter as seguinte sequência de atividades:

  • 1. Aula introdutória: encontro com aula síncrona introduzindo o tópico ou parte dele.
  • 2. Tutorial: roteiro autoexplicativo com atividades associadas ao tema, acompanhado de videoaulas de 30'. Essa atividade será assistida pelos monitores e professores em um esquema de revezamento, tanto pelo Google Meet quanto pelo fórum da disciplina no moodle do e-disciplinas.
  • 3. Apostila online: material complementar ao tópico que deve ser lido e exercitado. Fazer as atividades da apostila ajuda muito na fixação e complementação da linguagem.
  • 4. Exercícios: exercícios que serão submetidos à plataforma notaR, uma sistema de correção automática de exercícios e gerenciamento de notas, criado para esta disciplina.
  • 5. Discussão síncrona : atividade de duração de cerca de uma horas e meia no Google Meet, mediada pela equipe da disciplina, para tirar dúvidas gerais e fazer um fechamento do tema tratado.

Atividades Preparatórias

Faça as Atividades Preparatórias até antes do início das aulas

Matricula Veja informações em: matricula.

Informações Gerais

Disciplina oferecida pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia da Universidade de São Paulo

Professor Responsável

Professores Colaboradores

Colaboração

  • Andre Chalom (notaR)
  • Mali Salles (notaR)

Monitores

  • Luisa Truffi
  • Irina Lerner
  • Rafael Melhem
  • Marcel Amaral
  • JP Alencar
  • Danilo Mori
  • Vitor Rios
  • Pamela Santana

Período e Horários

  • Disciplina condensada programada para o período de 06 de setembro a 27 de junho de 2022.
  • Aulas teóricas síncronas, segundas, quartas e sextas pelas manhãs, 9:00-10:30h e pelas tardes das 16:00- 17:30h.
  • Aulas assíncronas com vídeo aulas, tutoriais e exercícios práticos: segundas, quartas e sextas 10:30-16:00 horas, com atendimento online pelo meet.
  • Atendimento assíncrono pelo forum terças e quintas, 9:00-18:00 horas.

Locais das aulas

  • Aulas e atendimento síncronos: Google Meet
  • Aulas e atendimento assíncronos: wiki e fórum da disciplina

Programação

  • Faça as Atividades Preparatórias antes do primeiro dia de aula.
  • A disciplina consiste de aulas teóricas às segundas, quartas e sextas, seguidas de tutoriais e exercícios com o apoio dos monitores.
  • Espera-se que as terças e quintas estejam reservadas para estudo. Nesses dias os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo Forum online.
Primeira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
01-05/06 livre livre Atividades Preparatórias DIY
06/06 9:00-10:30 Google Meet Introdução ao curso & Dúvidas das atividades preparatórias Alexandre
06/06 11:00-16:00 Fórum Tutorial de Funções Matemáticas Equipe
06/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Funções Matemáticas Equipe
08/06 09:00-10:30 Google Meet Aula Leitura e Manipulação de Dados Alexandre
08/06 11:00-16:00 Forum Tutorial Leitura e Manipulação de Dados Equipe
08/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Leitura e Manipulação de dados Equipe
10/06 09:00-10:30 Fórum Tutorial Tutorial Análise Exploratória de Dados Equipe
10/06 11:00-16:00 Google Meet Discussão Tutorial AED Equipe
10/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Análise Exploratória de Dados Equipe
Segunda Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
13/06 9:00-10:00 Fórum Tutorial de Gráficos I Equipe
13/06 10:30-12:00 Google Meet Aula Gráficos I Alexandre
13/06 13:30-16:00 Google Meet Plantão Gráficos I Equipe
13/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Gráficos I Equipe
15/06 09:00-10:30 Forum Tutorial Gráficos II Equipe
15/06 10:30-12:00 Google Meet Aula Gráficos II Alexandre
15/06 13:30-16:00 Google Meet Plantão Gráficos II Equipe
15/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Gráficos Equipe
Terceira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
20/06 09:00-10:30 Forum Tutorial Teste de Significância Equipe
20/06 010:30-12:00Google Meet Aula Teste de Significância Alexandre
20/06 13:30-16:00Google Meet Plantão Teste de Significância Equipe
20/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Teste de Significância Equipe
22/06 9:00-10:30 Fórum Tutorial de Modelos Lineares Equipe
22/06 10:30-12:00 Google Meet Aula de Modelos Lineares Alexandre
22/06 13:30-16:00 Google Meet Plantão de Modelos Lineares Equipe
22/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Modelos Lineares Equipe
24/06 9:00-10:30 Fórum Tutorial Reamostragem Equipe
24/06 10:30-12:00Google Meet Aula Reamostragem Alexandre
24/06 13:30-16:00Google Meet Plantão Reamostragem Equipe
24/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Reamostragem Equipe
Quarta Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
27/06 09:00-10:30 Fórum Tutorial Funções Equipe
27/06 10:30-12:00Google Meet Aula Funções Alexandre
27/06 13:30-16:00 Google Meet Plantão Funções Equipe
27/06 16:00-17:30 Google Meet Fechamento Curso Equipe

Bibliografia Básica

A quantidade de material disponível sobre programação em R é muito extensa. Aqui apresentamos uma compilação da documentação oficial que consideramos mais importante e algumas fontes que avaliamos ser mais interessante.

Para os que acompanham cursos online, indicamos o curso de programação em R no Coursera oferecido pela Johns Hopkins University.

Livros

William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002. Conhecido na comunidade R como “The Book”, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o MASS1), que faz parte da instalação básica do R. Visite o site do livro para atualizações, exercícios e muito mais.

John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002. Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, car, tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o site do livro.

John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005. Derivado de manual disponível gratuitamente no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o site do livro, e o pacote usingR.

Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007. Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o site do livro.

Documentação On Line

NOTA: Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção Contributed Documentation do site do R.

Venables, W.; Smith, D.M; & R Development Team An Introduction to R. Manual online. Manual oficial de introdução ao R.

Carlos Alzola and Frank E. Harrell An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.

Petra Kuhnert and Bill Venables An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing. Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.

Veja também

Duas dicas do monitor Vitor Rios:

  • Beginner's guide to R - uma breve introdução sobre a linguagem publicada na revista online ComputerWorld. Um guia compacto sobre tópicos básicos.
  • Advanced R. Compilação online do livro de mesmo nome de autoria de Hadley Wickham. Descrição do publico alvo, pelo autor: “The book is designed primarily for R users who want to improve their programming skills and understanding of the language.”

Outros Recursos

  • swiRl: pacote com curso interativo no próprio console do R.
  • Taskviews: são listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no CRAN2). Para nossa área, p.ex, há os views Environmetrics, Multivariate, Genetics, Spatial. Todo espelho de CRAN mantém uma cópia dos taskviews. Para o espelho da FMV-USP o link é http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/.
  • The R Journal: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
  • Journal of Statistical Software: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre uso do R em ecologia, e outro sobre análises de redes (com ênfase para dados de ciências sociais).
  • Quick R, de Rob Kabakoff: um guia rápido on line muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
  • The R Wikibook: manual muito completo na coleção de Wiki Books.
1)
este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN
2)
Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R
01_curso_atual/start.txt · Última modificação: 2022/06/10 18:46 por adalardo