seedR package: R Documentation

Análise básica para dados de germinação em experimentos controlados

Description:

A partir de um data.frame padrão com dados brutos de sementes germinadas
em cada dia de observação e réplica por tratamento, a função realiza 
o cálculo da porcentagem final de sementes germinadas, gerando um boxplot
para comparação de tratamentos e também calcula o tempo médio de germinação
... 


Usage:

seedR= function(dados,calc="PG",grafico=FALSE)

Arguments:
dados: Necessita da leitura de uma tabela com as seguintes especificações:
- Primeira célula: deve estar escrito a palavra "trat" com letra minúscula- se refere a coluna de tratamento
- Primeira coluna: nomes dos tratamentos
- Primeira linha: Observações realizadas
- Segunda linha: Quantos dias a partir do início do experimento foi feita a observação
- Demais células: contagens de sementes correspondentes por dia de observação/réplica
(vide tabela de exemplo)

calc: fornece as opções de cálculos realizados pela função. Se "PG" porcentagem 
de germinação, se "GT" tempo médio de germinação. Seu default é PG

grafico: define se haverá a geração de um gráfico tipo boxplot mostrando os 
dados por tratamento. Seu default é FALSE

Value:

A função irá realizar os cálculos de porcentagem de germinação ou tempo médio de
germinação "Mean Germination Time" para cada uma das réplica. Os resultados apresentados são
- Uma nova tabela com uma coluna contendo os dados calculados para cada réplica
- A média calculada dos parametros inseridos por tratamento.
- Os desvios padrões por tratamento

Author
Nathalia Bonani

References:

RANAL, M. A.; SANTANA, D. G. How and why to measure the germination
process? Revista Brasileira de Botânica.São Paulo, v.29, n.1,
p.1-11. 2006.

Examples:

dados= read.table("teste.csv", sep=";", header=TRUE, as.is=T)
seedR(dados,calc="PG",grafico=TRUE)