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05_curso_antigo:r2023:start

Curso IBUSP/ESALQ - 2023

  • Em 2023, o curso será oferecido presencialmente no período de 14 de agosto a 22 de setembro. As aulas presenciais serão oferecidas simultaneamente nos campi Butantan e ESALQ da USP, com equipes presenciais em cada uma destas unidades.
  • Se você está matriculado na disciplina, deverá obrigatoriamente fazer as Atividades Preparatórias no período de 14 a 18 de agosto. Neste período estaremos oferecendo atendimento pelo Fórum discoRd e presencialmente.
  • Veja as informações sobre a matrícula antes de consultar os professores.
  • O vídeo abaixo descreve como foi o esquema da disciplina remota em 2020. Este ano a disciplina não será remota, será híbrida, mas iremos seguir, em parte, esse mesmo esquema. Por favor, assista para ter uma ideia de como o curso se dará.

Em 2023, o período de aula presenciais com transmissão ao vivo será entre os dias 21 de agosto a 15 de setembro. Note que, uma semana antes e uma depois deste período teremos atividades obrigatórias do curso, porém sem aulas expositivas e presenciais.


O fórum Nabble foi desativado e não iremos mais usá-lo. Para a turma de 2023 utilizaremos o Fórum discoRd


O notar mudou para http://notar.ib.usp.br

Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação e material sobre a disciplina oferecida pela programa de Pós-Graduação em Ecologia do Instituto de Biociências e pelo programa de Pós-Graduação em Recursos Florestais da ESALQ, ambos da Universidade de São Paulo.

Curso Presencial em dois Campi

A partir do ano de 2023, o curso é oferecido simultaneamente pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia do IBUSP e no Programa de Recursos Florestais da ESALQ. Em cada um desses programas, teremos uma equipe trabalhando presencialmente com os alunos. O curso é baseado em 9 tópicos, para cada um dos tópicos do curso, iremos ter as seguinte sequência de atividades:

  • 1. Aula introdutória: encontro com aula expositiva ao vivo introduzindo o tópico ou parte dele. Para a unidade que não terá a aula presencial, ela será transmitida online via uma sala do Google Meet ou pelo canal do youtube como live.
  • 2. Tutorial: roteiro autoexplicativo com atividades associadas ao tema, acompanhado de videoaulas de 30'. Essa atividade será assistida pelos monitores e professores em um esquema de revezamento, tanto pelo Fórum discoRd no moodle do e-disciplinas como presencialmente em cada unidade.
  • 3. Apostila online: material complementar ao tópico que deve ser lido e exercitado. Fazer as atividades da apostila ajuda muito na fixação e complementação da linguagem.
  • 4. Exercícios: exercícios que serão submetidos à plataforma notaR, um sistema de correção automática de exercícios e gerenciamento de notas, criado especialmente para esta disciplina.
  • 5. Fechamento do tópico : atividade de duração de cerca de uma hora e meia, mediada pela equipe da disciplina, para tirar dúvidas gerais e fazer um fechamento do tema tratado.

Atividades Preparatórias

Faça as atividades do pre_curso até antes do início das aulas presenciais/ao vivo.

Matricula Veja informações em: matrícula.

Informações Gerais

Disciplina oferecida pelos Programas de Pós-Graduação em Ecologia (IB) e Recursos Florestais (ESALQ), ambos da Universidade de São Paulo.

Professores Responsáveis

Professores Colaboradores

Coordenação notaR

  • Andre Chalom
  • Mali Salles

Monitores LabTrop

Monitores Ecologia e outros

Locais das aulas

  • Aulas presenciais: IBUSP (Sala Multimídia 1 do Centro Didático1)) e ESALQ (Sala de Treinamento da SIESALQ)

Atenção alunos do IBUSP por conflitos no uso da sala, nos dias

21/08, 28/08 e 11/09 as aulas serão ministradas no Auditorio 2 e a prática na sala de Anatomia, ambas no Centro Didático. Nestes dias teremos apenas 20 notebooks disponíveis. Quem puder traga o seu!

  • Atendimento síncronos: Google Meet
  • Aulas e atendimento assíncronos: wiki e Fórum discoRd da disciplina

Avaliação

Nota Final

* 80% nota = média dos exercícios de tópicos2)

* 20% nota = média da lista final de exercícios

Cálculo da nota dos exercícios de tópicos

  • Média final:
    • exclui o tópico com menor nota
    • média ponderada dos tópicos restantes
| Cálculo da nota final
 
notaFinal <- 0.8 * sum(notaTopicos[- which.min(notaTopicos)]) + 0.2 * notaLista
2020/08/12 06:11

Programação

  • Faça as Atividades Preparatórias antes do primeiro dia de aula.
  • A disciplina consiste de aulas teóricas às segundas, quartas e sextas, seguidas de tutoriais e exercícios com o apoio dos monitores.
  • Espera-se que as terças e quintas estejam reservadas para estudo. Nesses dias os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo Fórum discoRd.
Primeira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
14-18/08 livre livre Atividades Preparatórias Faça você mesmo!
Segunda Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
21/08 9:00-10:30 Presencial Introdução ao curso & Dúvidas das atividades preparatórias Alexandre
21/08 11:00-12:00 Presencial e Fórum Tutorial de Funções Matemáticas Equipe
21/08 14:00-17:30 Presencial Funções Matemáticas Equipe
23/08 09:00-10:30 Presencial Aula Leitura e Manipulação de Dados Alexandre
23/08 11:00-12:00 Presencial e Fórum Tutorial Leitura e Manipulação de Dados Equipe
23/08 14:00-17:30 Presencial Leitura e Manipulação de dados Equipe
25/08 09:00-10:30 Presencial e Fórum Tutorial Tutorial Análise Exploratória de Dados Equipe
25/08 11:00-12:00 Presencial Discussão Tutorial AED Equipe
25/08 14:00-17:30 Presencial Análise Exploratória de Dados Equipe
Terceira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
28/08 9:00-10:00 Presencial e Fórum Tutorial de Gráficos I Equipe
28/08 10:30-12:00 Presencial Aula Gráficos I Alexandre
28/08 14:00-16:00 Presencial e Fórum Plantão Gráficos I Equipe
28/08 16:00-17:30 Presencial Fechamento Gráficos I Equipe
30/08 09:00-10:30 Presencial e Fórum Tutorial Gráficos II Equipe
30/08 10:30-12:00 Presencial Aula Gráficos II Alexandre
30/08 14:00-16:00 Presencial e Fórum Plantão Gráficos II Equipe
30/08 16:00-17:30 Presencial Fechamento Gráficos Equipe
01/09 09:00-10:30 Presencial e Fórum Tutorial Teste de Significância Equipe
01/09 010:30-12:00Presencial Aula Teste de Significância Alexandre
01/09 14:00-16:00Presencial e Fórum Plantão Teste de Significância Equipe
01/09 16:00-17:30 Presencial Fechamento Teste de Significância Equipe
Semana da Pátria
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
04-08/09 livre livre Não haverá aula presencial Descansem!
Quarta Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
11/09 9:00-10:30 Presencial e Fórum Tutorial de Modelos Lineares Equipe
11/09 10:30-12:00 Presencial Aula de Modelos Lineares Alexandre
11/09 14:00-16:00 Presencial e Fórum Plantão de Modelos Lineares Equipe
11/09 16:00-17:30 Presencial Fechamento Modelos Lineares Equipe
13/09 9:00-11:30 Presencial Aula Reamostragem Alexandre
13/09 14:00-16:00 Presencial e Fórum Tutorial Reamostragem Equipe
13/09 16:00-17:30 Presencial e Fórum Plantão Reamostragem Equipe
15/09 9:00-11:30 Presencial Aula Funções Alexandre
15/09 14:00-16:00Presencial e Fórum Tutorial Funções Equipe
15/09 16:00-17:30 Presencial e Fórum Plantão Funções Equipe
Quinta Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
18- 22/09 livre Fórum Lista de Exercícios Finais Atendimento pela Equipe

Bibliografia Básica

A quantidade de material disponível sobre programação em R é muito extensa. Aqui apresentamos uma compilação da documentação oficial que consideramos mais importante e algumas fontes que avaliamos ser mais interessante.

Para os que acompanham cursos online, indicamos o curso de programação em R no Coursera oferecido pela Johns Hopkins University.

Livros

William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002. Conhecido na comunidade R como “The Book”, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o MASS3), que faz parte da instalação básica do R. Visite o site do livro para atualizações, exercícios e muito mais.

John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002. Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, car, tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o site do livro.

John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005. Derivado de manual disponível gratuitamente no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o site do livro, e o pacote usingR.

Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007. Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o site do livro.

Documentação On Line

NOTA: Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção Contributed Documentation do site do R.

Venables, W.; Smith, D.M; & R Development Team An Introduction to R. Manual online. Manual oficial de introdução ao R.

Carlos Alzola and Frank E. Harrell An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.

Petra Kuhnert and Bill Venables An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing. Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.

Veja também

Duas dicas do monitor Vitor Rios:

  • Beginner's guide to R - uma breve introdução sobre a linguagem publicada na revista online ComputerWorld. Um guia compacto sobre tópicos básicos.
  • Advanced R. Compilação online do livro de mesmo nome de autoria de Hadley Wickham. Descrição do publico alvo, pelo autor: “The book is designed primarily for R users who want to improve their programming skills and understanding of the language.”

Outros Recursos

  • swiRl: pacote com curso interativo no próprio console do R.
  • Taskviews: são listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no CRAN4). Para nossa área, p.ex, há os views Environmetrics, Multivariate, Genetics, Spatial. Todo espelho de CRAN mantém uma cópia dos taskviews. Para o espelho da FMV-USP o link é http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/.
  • The R Journal: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
  • Journal of Statistical Software: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre uso do R em ecologia, e outro sobre análises de redes (com ênfase para dados de ciências sociais).
  • Quick R, de Rob Kabakoff: um guia rápido on line muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
  • The R Wikibook: manual muito completo na coleção de Wiki Books.
1)
Nas segundas as aulas serão no Auditório 2 e na sala de Anatomia
2)
veja cálculo no quadro abaixo
3)
este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN
4)
Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R
05_curso_antigo/r2023/start.txt · Última modificação: 2024/07/15 17:42 (edição externa)