No tutorial 6, acho que tem um comando fora de lugar, coloquei ele entre aspas:

macho=c(120,107,110,116, 114, 111, 113,117,114,112)
femea=c(110,111,107, 108,110,105,107,106,111,111)

media.m=mean(macho)
media.m
media.f=mean(femea)
mean(femea)
"vetor.media"
chacal=c(macho,femea)
sexo=factor(rep(c("macho","femea"),each=10))

No começo da parte de ANOVA, tem os seguintes comandos para realização do grafico:

plot(vetor.obs,vetor.dados,ylim=c(0,20),pch=(rep(c(15,16,17),each=10)),col=vetor.cor,ylab="Variável Resposta", xlab="Observações")
	for(i in 1:30)
	{
	lines(c(i,i),c(vetor.dados[i],mean(vetor.dados)),col=vetor.cor[i])
	}
	abline(h=media.geral)

No entanto, as variáveis vetor.obs, vetor.dados e vetor.cor não foram definidas. A variável media.geral é definida apenas na seção seguinte.

Mais pra frente, no cálculo de somatória quadrática intra grupo:

solos
media.solos
ss.are=sum((are-media.solos["are"])^2)
ss.are
ss.arg=sum((arg-media.solos["arg"])^2)
ss.arg
ss.hum=sum((hum-media.solos["hum"])^2)
ss.hum
ss.intra=ss.are+ss.arg+ss.hum
ss.intra

A variável media.solos não foi definida, o que impossibilita o cálculo das demais.