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Curso 2011

Bem vindo(a). Aqui você encontrará a programação de nossa disciplina, ministrada em março de 2010 no Instituto de Biocências da USP, e outras informações importantes. Além disto, há algumas atividades prévias a cumprir antes do início das aulas.

INFORMAÇÕES IMPORTANTES

  • 11 de maio: Foram publicadas as notas da disciplina, veja na página avaliação 2011
  • O horário de plantão na sala multimídia no dia 05/04 foi extendido para a tarde toda: 14hs as 18hs.
  • 21 março: Encaminhamos pelo menos três mensagens coletivas aos alunos regularmente matriculados (email credenciado no sistema Janus), caso não tenha recebido nenhuma, envie uma mensagem aos monitores e professores solicitando que seu endereço de email seja atualizado
  • INICIO DO CURSO

Dia 21 de março reservado para os alunos executarem as atividades preparatórias Não deixe de faze-las!!!

Atividades Preparatórias

As aulas presenciais da disciplina iniciam no dia 23 de março. Veja a Programação abaixo

Informações Gerais

Disciplina oferecida pelo Programa de Pós-Graduação em Ecologia da Universidade de São Paulo

Professores

Monitores

  • Camila Mandai - PG Ecologia, IB-USP
  • Daniela Zanelato - PG Ecologia, IB-USP
  • Daniel Caetano - PG Ecologia, IB-USP
  • Fábio Machado - PG Zoologia, MZUSP
  • Gabriel Frey - PG Ecologia, IB-USP
  • Leandro Tambosi - PG Ecologia, IB-USP

Período e Horários

  • Disciplina condensada, 21 de março a 08 de abril de 2011
  • Aulas teóricas segunda quartas e sextas pelas manhãs, das 8:30-12:30 .
  • Laboratório de informática: tutorial das 14:00-15:30, exercícios das 16:00-18:00

Locais das aulas

As aulas ocorrerão em diferentes salas do Instituto de Biociências da USP, esteja atento(a) ao programa abaixo.

O Laboratório Multimídia fica no centro didático (prédio da biblioteca) andar térreo.

Os AGs (Auditórios Gerais) ficam nos respectivos prédios departamentais da Botânica e Zoologia.

Os Auditórios 1 e 2 ficam no primeiro andar do Centro Didático.

Programação

  • No primeiro dia de aula os alunos devem executar as Atividades Preparatórias.
  • A disciplina consiste de aulas teóricas às segundas, quartas e sextas, seguidas de tutoriais e exercícios monitorados (plantões).
  • Espera-se que as terças e quintas estejam reservadas para estudo. Nesses dias os professores e monitores acompanham as dúvidas dos alunos pelo Forum disciplina R
Primeira Semana
Data Período Local Assunto Instrutor(es)
21/03 8:30-17:30 livre Atividades Preparatórias Plantão de dúvidas - Fórum
23/03 8:30-12:30AG BotânicaFilosofia e histórico da linguagem R, Introdução à linguagem R Paulo
23/03 14:00-16:00AG BotânicaTira-dúvidas dos Tutoriais de introdução ao R Paulo e monitores
23/03 16:00-18:30AG BotânicaFunções matemáticas e estatísticas no R Paulo
24/03 9:00-12:30MultimídiaPlantão funções Matemáticas Daniel, Fábio, Gabriel
25/03 8:30-12:30Ag.ZooLeitura e Manipulação de Dados Alexandre
25/03 14:00-18:30 Auditório 1Plantão Manipulação de dados Daniel, Fábio, Gabriel
Segunda Semana
28/03 8:30-12:30Auditório 2Análise Exploratória de Dados Paulo
28/03 12:30-17:30Auditório 1Plantão Análise Exploratória de Dados Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
29/03 9:00-12:30Lab.MultimídiaPlantão de dúvidas: matéria até aqui Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
30/03 8:30-12:30Auditório 2GráficosAlexandre
30/03 14:00-17:30Lab.MultimídiaPlantão gráficos Daniela, Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
01/04 8:30-12:00AG ZooTestes de significância Alexandre
01/04 14:00-15:30Auditório 1Plantão testes de significância Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
Terceira Semana
04/04 8:30-12:30AG ZooRegressão linear simples Paulo
04/04 14:00-15:30MultimídiaIntrodução a Regressão linear múltipla Paulo
05/04 14:00-18:00MultimídiaPlantão regressão linear Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
06/04 8:30-10:30Auditório 2Noções de Programação em Linguagem R: construção de funções simples Alexandre
06/04 10:30-12:30Auditório 2 Noções de Programação em Linguagem R: randomização Alexandre
06/04 14:00-16:00Lab. MultimídiaPlantão Programação Daniela, Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
08/04 8:30-12:30Ag ZooTira dúvidas Modelos Lineares
Tira dúvidas programação
Equipe
08/04 14:00-14:30Auditório 2RcomanderAlexandre e Paulo
08/04 14:30-17:00Auditório 2Exemplos de uso do R Daniel, Fábio, Gabriel, Leandro
08/04 17:00-17:30Auditório 2Avaliação da disciplinaEquipe

Bibliografia Básica

Livros

William N. Venables and Brian D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer, New York, 2002. Conhecido na comunidade R como “The Book”, é a referência básica do usuário, mas é preciso alguma experiência para aproveitá-lo bem. Seu pacote companheiro é o MASS1), que faz parte da instalação básica do R. Visite o site do livro para atualizações, exercícios e muito mais.

John Fox. An R and S-Plus Companion to Applied Regression. Sage Publications, Thousand Oaks, CA, USA, 2002. Excelente livro sobre regressão linear, e uma ótima introdução à construção de modelos no R. O pacote companheiro, car, tem ótimas funções para diagnóstico de regressões. Visite também o site do livro.

John Verzani. Using R for Introductory Statistics. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, FL, 2005. Derivado de manual disponível gratuitamente no site do autor, esta é uma das melhores introduções à linguagem para principiantes. Muito didático e com ótimos exercícios. Veja também o site do livro, e o pacote usingR.

Crawley, M. J. The R Book. Wiley, New York, 2007. Um livro muito completo e feito por um ecólogo, para ensinar estatística e a linguagem. Referência obrigatória para pessoas da área de biologia, principalmente de ecologia. Veja também o site do livro.

Documentação On Line

NOTA: Selecionamos aqui três manuais on-line que nos parecem boas introduções. Há muito mais na seção Contributed Documentation do site do R.

Venables, W.; Smith, D.M; & R Development Team An Introduction to R. Manual online. Manual oficial de introdução ao R.

Carlos Alzola and Frank E. Harrell An Introduction to S and the Hmisc and Design Libraries O Pacote Hmisc veio do S-Plus, e tem várias funções muito úteis para manipulação e análise exploratória de dados. O manual é extenso e é uma referência muito completa sobre a linguagem S.

Petra Kuhnert and Bill Venables An Introduction to R: Software for Statistical Modelling & Computing. Apostila de 360 páginas de curso de Introdução ao R, além dos scripts de aula e conjuntos de dados.

Outros Recursos

  • Taskviews: São listas comentadas dos pacotes do R para uma certa área ou tema, mantidas no CRAN2). Para nossa área, p.ex, há os views Environmetrics, Multivariate, Genetics, Spatial. Todo espelho de CRAN mantém uma cópia dos taskviews. Para o espelho da FMV-USP o link é http://www.vps.fmvz.usp.br/CRAN/web/views/.
  • CRANTASTIC!: Excelente sítio com resumos de todos os pacotes do CRAN3). Tem recursos para buscas de pacotes e funções por assuntos, resumos de cada pacote, avaliações de pacotes e muito mais. Juntamente com as taskviews, é o recurso básico para encontrar o pacote que você busca no R.
  • The R Journal: periódico mantido pelo R Project, onde são publicados artigos sobre novos pacotes, dicas para programadores e usuários, e uso do R nas mais variadas aplicações estatísticas.
  • Journal of Statistical Software: tem sido o principal veículo sobre análises e novos pacotes no R. Muitos dos principais pacotes usados em ecologia e biologia têm artigos com exemplos de aplicação neste periódico. Há fascículos especiais, incluindo um sobre uso do R em ecologia, e outro sobre análises de redes (com ênfase para dados de ciências sociais).
  • Quick R, de Rob Kabakoff: um guia rápido on line muito bem organizado e fácil de consultar. Foi criado para facilitar a migração de usuários de outros pacotes, mas é um recurso de consulta rápida útil para todos.
  • The R Wikibook: manual muito completo na coleção de Wiki Books.
1)
este e os demais pacotes citados aqui estão disponíveis no CRAN
2) , 3)
Comprehensive R Archive Network, repositório oficial dos programas e pacotes do R
05_curso_antigo/r2011/start.txt · Última modificação: 2020/08/12 06:04 (edição externa)